鲟类线粒体基因组分子标记、遗传距离及系统演化分析
文献类型：CNKI期刊论文
| 作者 | 申欣; 田美; 孟学平; 程汉良; 彭永兴; 李士虎 |
| 发表日期 | 2012-07-15 |
| 出处 | 水产科学
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| 关键词 | 鲟形目 线粒体基因组 选择压力 分子标记 遗传距离 系统演化 |
| 英文摘要 | 鲟形目鱼类9个物种线粒体基因组的基因组成高度保守,均编码37个基因,长度为16 438bp(达氏鲟)～16 760bp(欧洲鳇)。主编码链的A+T含量为53.3%(密苏里铲鲟)～54.6%(中华鲟和匙吻鲟)。9个蛋白质编码基因(atp6、atp8、cob、cox1、cox3、nad1、nad3、nad4和nad4L)编码氨基酸数目相同,分别为227、55、380、517、261、324、116、460和98个。15个主编码基因的差异位点分析表明,在鲟形目鱼类分子生态和群体遗传的研究中,nad5、nad4、cox1和cob基因是理想的分子标记,可用于分析其不同物种和群体之间的遗传多样性。在9种鲟形目鱼类中,遗传距离最小的是中华鲟与俄罗斯鲟(0.0070),遗传距离最大的是闪光鲟与白鲟(0.1777)。2个科之间的遗传距离远远大于科内部的遗传距离,因此支持传统的科级分类。基于线粒体基因组的系统发育结果表明,鲟形目鱼类分为2支:鲟科的7个物种和匙吻鲟科的2个物种分属2个类群(BPN=100,BPM=100,BPP=100),这与经典的系统分类观点一致。隶属于鲟属的中华鲟、俄罗斯鲟及闪光鲟与欧洲鳇聚类,支持率非常高(BPN=100,BPM=100,BPP=100),而将同为鲟属的高首鲟和达氏鲟排除在外,从而表明,线粒体基因组的数据支持将欧洲鳇并入鲟属。基于线粒体基因组数据支持鲟科内部的亲缘关系为:{[(中华鲟+俄罗斯鲟)+闪光鲟]+欧洲鳇}+(高首鲟+达氏鲟),密苏里铲鲟与它们关系最远。 |
| DOI标识 | 10.16378/j.cnki.1003-1111.2012.07.007 |
| 文献子类 | CNKI期刊论文 |
| 资助机构 | 国家自然科学基金资助项目(40906067) ; 江苏省“青蓝工程”人才基金资助项目(苏教师[2010]27号) ; 江苏省海洋生物技术重点实验室基金资助项目(2009HS13,2009HS14) ; 淮海工学院自然科学基金资助项目(Z2009048) |
| 卷 | v.31期:07页:31-36 |
| 语种 | 中文; |
| 分类号 | S917.4 |
| ISSN号 | 1003-1111 |
| 源URL | [http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/191199]  |
| 专题 | 中国科学院海洋研究所 |
| 作者单位 | 1.淮海工学院海洋学院 2.中国科学院海洋研究所 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 申欣,田美,孟学平,等. 鲟类线粒体基因组分子标记、遗传距离及系统演化分析. 2012. |
入库方式： OAI收割
来源：海洋研究所
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