栉孔扇贝BES-SSR的开发及遗传多样性分析
文献类型：CNKI期刊论文
| 作者 | 张秀英; 张晓军; 赵翠; 常亚青; 郇聘 ; 李富花; 相建海
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| 发表日期 | 2012-06-15 |
| 出处 | 水产学报
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| 关键词 | 栉孔扇贝 BAC末端序列 微卫星 遗传多样性 |
| 英文摘要 | 通过分析栉孔扇贝BAC末端序列,发现大量微卫星DNA;随机选择14个多态性BES-SSR标记,在我国栉孔扇贝大连群体(DL)和青岛群体(QD)中验证标记的可用性,同时对这两个群体的遗传结构及其分化进行研究。结果表明,从17447条BESs中得到微卫星3374个,以四核苷酸重复为主(26.6%),五核苷酸重复次之(17.7%),六核苷酸重复最少(12.0%)。BES-SSR引物的扩增效率为77.3%(99/128),在作图亲本中的多态比例为33.6%(43/128),14个基因座在两群体中的平均等位基因数Na分别为18.9286和26.2143,平均有效等位基因数Ne为11.7505和17.0891,平均观察杂合度Ho为0.5100和0.4204,平均期望杂合度He为0.9156和0.9450,多态信息含量PIC分别为0.8940和0.9302,群体遗传多样性水平较高。两群体间的无偏遗传相似性系数为0.4879,遗传距离为0.7177,平均基因分化指数FST为0.0243,基因流Nm为10.0179,显示群体间遗传分化程度较弱,遗传变异主要来自于群体内个体之间,经Hardy-Weinberg平衡检验,两群体普遍存在杂合子缺失现象。研究表明,所开发的BES-SSR是高度多态位点,用于群体遗传多样性分析效果很好,显示BES是微卫星标记开发和应用的重要资源。 |
| 文献子类 | CNKI期刊论文 |
| 资助机构 | 国家自然科学基金(30730071/C190203) |
| 卷 | v.36期:06页:18-27 |
| 语种 | 中文; |
| 分类号 | S917.4 |
| ISSN号 | 1000-0615 |
| 源URL | [http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/191218]  |
| 专题 | 中国科学院海洋研究所 |
| 作者单位 | 1.中国科学院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室 2.中国科学院研究生院 3.大连海洋大学水产与生命学院 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 张秀英,张晓军,赵翠,等. 栉孔扇贝BES-SSR的开发及遗传多样性分析. 2012. |
入库方式： OAI收割
来源：海洋研究所
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