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凡纳滨对虾肠道微生物宏基因组Solexa测序及其初步分析

文献类型:CNKI期刊论文

作者严雪平; 袁剑波; 刘斌
发表日期2012-06-15
出处海洋科学
关键词肠道微生物宏基因组 CTAB Solexa测序
英文摘要CTAB-酚/氯仿法提取新鲜凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)肠道微生物宏基因组DNA。结果表明:CTAB-酚/氯仿法提取总DNA的浓度达到92.5 ng/μL,半定量PCR法检测微生物基因组相对含量为69.9%。凡纳滨对虾肠道微生物宏基因组用于Solexa测序,生物信息学分析结果显示宏基因数据中64.1%的数据属于未知序列,35.5%属于真核生物,而已知的微生物和病毒序列所占比例仅有0.4%。
文献子类CNKI期刊论文
资助机构国家高技术研究发展计划(2007AA09Z444)
v.36;No.276期:06页:11-16
语种中文;
分类号S917.4
ISSN号1000-3096
源URL[http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/191228]  
专题中国科学院海洋研究所
作者单位1.中国科学院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室
2.中国科学院研究生院
推荐引用方式
GB/T 7714
严雪平,袁剑波,刘斌. 凡纳滨对虾肠道微生物宏基因组Solexa测序及其初步分析. 2012.

入库方式: OAI收割

来源:海洋研究所

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