凡纳滨对虾肠道微生物宏基因组Solexa测序及其初步分析
文献类型:CNKI期刊论文
作者 | 严雪平; 袁剑波; 刘斌 |
发表日期 | 2012-06-15 |
出处 | 海洋科学
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关键词 | 肠道微生物宏基因组 CTAB Solexa测序 |
英文摘要 | CTAB-酚/氯仿法提取新鲜凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)肠道微生物宏基因组DNA。结果表明:CTAB-酚/氯仿法提取总DNA的浓度达到92.5 ng/μL,半定量PCR法检测微生物基因组相对含量为69.9%。凡纳滨对虾肠道微生物宏基因组用于Solexa测序,生物信息学分析结果显示宏基因数据中64.1%的数据属于未知序列,35.5%属于真核生物,而已知的微生物和病毒序列所占比例仅有0.4%。 |
文献子类 | CNKI期刊论文 |
资助机构 | 国家高技术研究发展计划(2007AA09Z444) |
卷 | v.36;No.276期:06页:11-16 |
语种 | 中文; |
分类号 | S917.4 |
ISSN号 | 1000-3096 |
源URL | [http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/191228] ![]() |
专题 | 中国科学院海洋研究所 |
作者单位 | 1.中国科学院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室 2.中国科学院研究生院 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 严雪平,袁剑波,刘斌. 凡纳滨对虾肠道微生物宏基因组Solexa测序及其初步分析. 2012. |
入库方式: OAI收割
来源:海洋研究所
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