长心卡帕藻(Kappaphycus alvarezii)表达序列标记分析
文献类型：CNKI期刊论文
| 作者 | 刘晨临; 黄晓航; 刘建国 |
| 发表日期 | 2011-11-30 |
| 出处 | 海洋与湖沼
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| 关键词 | 长心卡帕藻 表达序列标记分析 抗逆基因 密码子使用频率 |
| 英文摘要 | 分别采用BlastX和Blast2go软件对453条非冗余的长心卡帕藻EST序列进行匹配分析和GO注释。结果表明,有281条序列与蛋白数据库中序列匹配,有132条序列被归属为3个子本体:分子功能、生物学过程和细胞组成。同时筛选到24个与逆境适应相关的基因,包括应对胁迫反应和抗氧化反应的基因。采用GCUA软件,进行长心卡帕藻基因密码子偏倚性的研究。结果表明其密码子偏倚性与其它红藻差别较大,平均G+C含量和密码子的第三位的G+C含量均较其它藻类偏低。上述工作为进一步研究长心卡帕藻基因及其功能奠定了基础。 |
| 文献子类 | CNKI期刊论文 |
| 资助机构 | 国家海洋公益项目,2012418039号、200705010号 ; 国家海洋局基本科研业务经费项目,2008G19号 |
| 卷 | v.42期:06页:54-60 |
| 语种 | 中文; |
| 分类号 | S917.3 |
| ISSN号 | 0029-814X |
| 源URL | [http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/191447]  |
| 专题 | 中国科学院海洋研究所 |
| 作者单位 | 1.国家海洋局第一海洋研究所海洋生态研究中心 2.中国科学院海洋研究所 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 刘晨临,黄晓航,刘建国. 长心卡帕藻(Kappaphycus alvarezii)表达序列标记分析. 2011. |
入库方式： OAI收割
来源：海洋研究所
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