长牡蛎17个fosmid-SSR标记的开发与分析
文献类型：CNKI期刊论文
| 作者 | 李慧娟; 亓海刚; 李莉; 闫喜武; 张国范 |
| 发表日期 | 2011-10-15 |
| 出处 | 水产学报
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| 关键词 | 长牡蛎 简单重复序列 基因组 遗传多样性 |
| 英文摘要 | 研究所用序列由长牡蛎fosmid文库末端测序获得。首先用TRF程序扫描序列获得一批重复单元为2碱基的候选SSR位点,然后在部分SSR序列两侧的保守区设计50对引物,对取自山东青岛的一个长牡蛎野生群体进行基因型分析。结果显示,共有17个SSR位点显示多态性,等位基因数(Na)平均为4,有效等位基因数(Ne)平均为2.82,平均杂合度观测值(Ho)和期望值(He)分别为0.395 9和0.628 8。其中,11个位点的多态信息含量(PIC)值均大于0.5,共有49个等位基因,适合对长牡蛎群体遗传结构的分析;6个位点0.25 |
| 文献子类 | CNKI期刊论文 |
| 资助机构 | 国家“九七三”重点基础研究发展计划(2010CB126402) ; 国家自然科学基金重点项目(40730845) ; 国家公益性行业(农业)科研专项(3-53) |
| 卷 | v.35期:10页:26-31 |
| 语种 | 中文; |
| 分类号 | S917.4 |
| ISSN号 | 1000-0615 |
| 源URL | [http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/191516]  |
| 专题 | 中国科学院海洋研究所 |
| 作者单位 | 1.大连海洋大学生命科学与技术学院 2.中国科学院海洋研究所 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 李慧娟,亓海刚,李莉,等. 长牡蛎17个fosmid-SSR标记的开发与分析. 2011. |
入库方式： OAI收割
来源：海洋研究所
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