基于线粒体DNA部分片段探讨条石鲷与斑石鲷的亲缘关系
文献类型：CNKI期刊论文
| 作者 | 肖志忠; 肖永双; 马道远; 徐世宏; 刘清华; 李军 |
| 发表日期 | 2011-09-15 |
| 出处 | 海洋学报(中文版)
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| 关键词 | 条石鲷 斑石鲷 线粒体DNA 遗传距离 分化时间 |
| 英文摘要 | 比较分析了条石鲷和斑石鲷线粒体基因组COI、Cytb基因以及D-loop片段总长度为1 948 bp的核苷酸序列,探讨了条石鲷和斑石鲷的遗传分化程度。两种间共检测到314个多态位点,蛋白质编码基因上的核苷酸替代主要是发生在密码子第3位点上的同义替换。核苷酸组成分析结果表明:三个目的片段的鸟嘌呤(G)含量普遍较低,在两个蛋白质编码基因密码子第3位点上表现得尤为明显。基于线粒体COI,Cytb基因和D-loop片段序列分析结果显示条石鲷和斑石鲷间平均遗传距离分别为0.097,0.080和0.172,属于属内种间差异水平。两种石鲷科鱼类在线粒体基因组不同片段上存在明显的遗传差异,核苷酸替代速率由大到小依次为D-loop>COI>Cytb。与以往的研究不同,条石鲷和斑石鲷线粒体COI基因片段上的核苷酸替代速率明显的高于Cytb基因片段,呈现出较快的进化速率。基于Cytb和ND5两个基因片段序列的分析结果表明:条石鲷和斑石鲷的分歧时间约为385万～530万a,分化事件发生于上新世早期(Early Pliocene)。 |
| 文献子类 | CNKI期刊论文 |
| 资助机构 | 国家农业科技成果转化资金项目(05EFN2166000453) ; 中国科学院创新前沿项目(KSCX2-YW-N-47-08) |
| 卷 | v.33期:05页:117-125 |
| 语种 | 中文; |
| 分类号 | S917.4 |
| ISSN号 | 0253-4193 |
| 源URL | [http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/191551]  |
| 专题 | 中国科学院海洋研究所 |
| 作者单位 | 中国科学院海洋研究所海洋生物技术工程研究发展中心 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 肖志忠,肖永双,马道远,等. 基于线粒体DNA部分片段探讨条石鲷与斑石鲷的亲缘关系. 2011. |
入库方式： OAI收割
来源：海洋研究所
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