海湾扇贝组织蛋白酶L基因编码区的克隆和分析
文献类型:CNKI期刊论文
作者 | 李娟; 李莉; 张国范 |
发表日期 | 2011-06-15 |
出处 | 海洋通报
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关键词 | 海湾扇贝 组织蛋白酶L基因 克隆 序列分析 |
英文摘要 | 通过cDNA末端快速扩增技术(RACE),从海湾扇贝(Argopecten irradians)中克隆得到了组织蛋白酶L基因(AiCL)的编码区全长,为1 095 bp,推测编码364个氨基酸。经比对与分析发现蛋白序列中存在4个组织蛋白酶L活性位点保守氨基酸:Q164,C170,H309,N329;6个极为保守的半胱氨酸残基:C167,C201,C210,C243,C302,C351。预测其N端17个氨基酸为信号肽序列,C端ASYPTV可能也是分泌信号。AiCL成熟蛋白分子由219个氨基酸构成,前体肽的切割位点预计在A145和M146之间。序列同源性分析中,AiCL蛋白序列与软体动物同源蛋白最为相似,序列一致性在50%以上,在系统进化树中与其它无脊椎动物组织蛋白酶L聚合到一起。通过SWISS-MODEL构建的AiCL成熟蛋白三维模型表明该蛋白空间结构高度保守。根据其序列特征,推测AiCL可能具有水解多种肌蛋白的活性。 |
文献子类 | CNKI期刊论文 |
资助机构 | 国家高技术研究发展计划(863计划,2010AA10A401) ; 国家自然基金(30800842) ; 国家公益性行业(农业)科研专项(3-53) |
卷 | v.30;No.174期:03页:101-106 |
语种 | 中文; |
分类号 | S917.4 |
ISSN号 | 1001-6392 |
源URL | [http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/191663] ![]() |
专题 | 中国科学院海洋研究所 |
作者单位 | 1.中国科学院海洋研究所 2.中国科学院研究生院 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 李娟,李莉,张国范. 海湾扇贝组织蛋白酶L基因编码区的克隆和分析. 2011. |
入库方式: OAI收割
来源:海洋研究所
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