条斑紫菜低覆盖度基因组草图分析
文献类型：CNKI期刊论文
| 作者 | 牛建峰; 高胜寒; 骆迎峰; 袁野; 王广策; 胡松年 |
| 发表日期 | 2011-06-15 |
| 出处 | 海洋科学
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| 关键词 | 条斑紫菜(Porphyra yezoensis) Solexa高通量测序 代谢通路 |
| 英文摘要 | 对条斑紫菜(Porphyra yezoensis)进行Solexa高通量测序,获得低覆盖度全基因组草图。该基因组草图大小约220 Mbp,GC质量分数53.08%;包含26 629个预测基因,其中16 409个基因具有内含子,平均每个基因含2.22个内含子;基因结构分析表明具有内含子的基因平均长度为2 214 bp,内含子平均大小319 bp;代谢通路分析表明嘌呤代谢是含有蛋白数量最多的代谢途径。本研究所得条斑紫菜低覆盖度全基因组草图快速获取了基因组大小和蛋白编码基因结构等基本信息,证明了使用Solexa高通量测序技术对条斑紫菜进行全基因组测序的可行性。 |
| 文献子类 | CNKI期刊论文 |
| 资助机构 | 国家863计划项目(2007AA09Z406) ; 国家自然科学基金项目(30830015) ; 国家973计划前期专项(2011CB411908) |
| 卷 | v.35;No.264期:06页:78-83 |
| 语种 | 中文; |
| 分类号 | S917.3 |
| ISSN号 | 1000-3096 |
| 源URL | [http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/191678]  |
| 专题 | 中国科学院海洋研究所 |
| 作者单位 | 1.中国科学院海洋研究所 2.中国科学院北京基因组研究所 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 牛建峰,高胜寒,骆迎峰,等. 条斑紫菜低覆盖度基因组草图分析. 2011. |
入库方式： OAI收割
来源：海洋研究所
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