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坛紫菜磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因的克隆与序列分析

文献类型:CNKI期刊论文

作者张晓娟; 王广策; 何林文; 陈昌生
发表日期2011-04-15
出处海洋科学
关键词坛紫菜 PEPC基因 序列分析 系统进化分析
英文摘要采用同源克隆的方法和RACE技术,从坛紫菜cDNA中获得了磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)的序列,该段序列含2538个核苷酸包含一个终止密码子TAG和191 bp的3′端非编码区(UTR),可编码846个氨基酸。该段序列中无跨膜结构和信号肽序列,推导的氨基酸序列中C末端第813位氨基酸是丙氨酸(A),表明是一个C3型基因。相似性分析表明,坛紫菜PEPC与其他物种有很高的一致性,约为35%~50%。结构分析显示,该序列具有两个PEPC基因保守活性位点和5种模式的其他功能位点。进化分析显示,坛紫菜PEPC羧化酶氨基酸序列更接近于C3型,进化上更为古老。该实验对进一步深入研究坛紫菜PEPC羧化酶功能及坛紫菜光合作用、碳代谢等具有重要的参考价值。
文献子类CNKI期刊论文
资助机构国家自然科学基金重点项目(30830015) ; 海洋公益性行业科研专项项目(201105008-2,201105023-7)
v.35;No.262期:04页:72-78
语种中文;
分类号S917.3
ISSN号1000-3096
源URL[http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/191727]  
专题中国科学院海洋研究所
作者单位1.中国科学院海洋研究所
2.中国科学院研究生院
3.天津科技大学海洋学院
4.集美大学渔业学院
推荐引用方式
GB/T 7714
张晓娟,王广策,何林文,等. 坛紫菜磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因的克隆与序列分析. 2011.

入库方式: OAI收割

来源:海洋研究所

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