长牡蛎(Crassostrea gigas)EST串联重复序列的组成和分布
文献类型：CNKI期刊论文
| 作者 | 张琳琳; 李莉; 张国范 |
| 发表日期 | 2011-04-15 |
| 出处 | 海洋科学
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| 关键词 | 长牡蛎(Crassostrea gigas) EST 串联重复序列 SSR 选择压力 |
| 英文摘要 | 长牡蛎(Crassostrea gigas)串联重复序列分析研究较少,为了研究其在基因组转录本的基本结构特征并为长牡蛎中遗传多样性研究中提供有益的信息,利用NCBI公共数据库中的57 139条长牡蛎ESTs序列对串联重复序列结构类型、分布、丰度等进行系统比较分析。分析结果表明:1)长牡蛎EST中共有小卫星串联重复序列8 392个,在大于100 bp重复类型中,162~167bp含量最高;2)长牡蛎EST SSR含量丰富,1 954个位点是EST-SSR标记开发的候选资源;3)EST-SSR重复数目和重复类型在5′UTR,CDS和3′UTR具有显著差异,CDS区承受更大的选择压力。 |
| 文献子类 | CNKI期刊论文 |
| 资助机构 | 国家重点基础研究发展计划项目(973计划,2010CB126402) ; 国家自然基金项目(40730845) ; 中国博士后基金(20090461270) |
| 卷 | v.35;No.262期:04页:11-16 |
| 语种 | 中文; |
| 分类号 | S917.4 |
| ISSN号 | 1000-3096 |
| 源URL | [http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/191728]  |
| 专题 | 中国科学院海洋研究所 |
| 作者单位 | 1.中国科学院海洋研究所 2.中国科学院研究生院 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 张琳琳,李莉,张国范. 长牡蛎(Crassostrea gigas)EST串联重复序列的组成和分布. 2011. |
入库方式： OAI收割
来源：海洋研究所
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