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西太平洋深海沉积物古菌多样性垂直分布

文献类型:CNKI期刊论文

作者王峰; 萨仁高娃; 李铁刚; 马学恩; 于心科
发表日期2010-08-15
出处地质学报
关键词西太平洋 16S rDNA 沉积物多样性
英文摘要以提取并纯化的西太平洋深海沉积物DNA为模板,利用古菌PCR特异性引物扩增出样品中古菌的16S rDNA片段,构建其克隆文库,建立阳性克隆子RFLP(Restriction Fragment Length Polymor-phism)酶切图谱。据酶切图谱对所获得的120个克隆进行测序,并与数据库中的序列进行比对,从而进行古菌的多样性和系统发育分析。结果表明,沉积物中扩增的16S rDNA古菌序列分别来自泉古生菌(Crenarchaeota)和广古生菌(Euryarchaeota),以Marine Benthic Group B(11.8%)、Marine Benthic Group D(13.6%)、Marine Crenarchaeotic Group(68.69%)为主。少量序列为South African Gold Mine Euryarchaeotic Group(1.07%)、Deep-Sea Hydrothermal Vent Euryarchaeotic Group(1.61%)、UIIB(1.25%)、VALIII(1.79%)、Marine Benthic Group E(0.18%)。以上结果表明西太平洋深海沉积物中有丰富多样的古菌群落。
DOI标识10.19762/j.cnki.dizhixuebao.2010.08.003
文献子类CNKI期刊论文
资助机构中国科学院知识创新工程重要方向项目(编号KZCX2-YW-211-03、KZCX2-YW-JC201-02)和中国科学院知识创新工程领域前沿项目(编号MGE2008KG06)资助成果
v.84期:08页:21-27
语种中文;
分类号Q913
ISSN号0001-5717
源URL[http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/192006]  
专题中国科学院海洋研究所
作者单位1.中国科学院海洋研究所海洋地质与环境重点实验室
2.内蒙古农业大学动物科学与医学学院
推荐引用方式
GB/T 7714
王峰,萨仁高娃,李铁刚,等. 西太平洋深海沉积物古菌多样性垂直分布. 2010.

入库方式: OAI收割

来源:海洋研究所

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