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口虾蛄肠道细菌种群多样性的分子分析

文献类型:CNKI期刊论文

作者王海青; 曲艳梅; 刘斌
发表日期2010-04-30
出处中国微生态学杂志
关键词口虾蛄 肠道细菌 16S DNA 克隆文库 限制性片段长度多态性
英文摘要目的探讨口虾蛄肠道细菌种群的多样性。方法通过不依赖于分离培养的分子生物学分析方法,以直接提取虾蛄肠道细菌的总DNA为模板经过PCR扩增16S DNA,然后经与T载体连接建立质粒文库。用限制性内切酶(BsuRⅠ和Hin6Ⅰ)对阳性克隆的PCR扩增产物进行限制性酶切片段长度多态性(RFLP)分析,选取有代表性的克隆进行测序。结果16S DNA序列通过CLUSTALX进行多序列比对及NCBI数据库中的BLAST分析后发现口虾蛄肠道细菌主要分成4类:未培养细菌,未培养支原体科细菌,未培养δ变形菌和马特斯支原体。结论口虾蛄肠道细菌种类较为简单,且多为未培养的细菌。
DOI标识10.13381/j.cnki.cjm.2010.04.006
文献子类CNKI期刊论文
资助机构科技部863计划(2007AA09Z444) ; 中科院百人计划 ; 中科院海洋功能基因组团队计划
v.22期:04页:35-38+42
语种中文;
分类号S917.4
ISSN号1005-376X
源URL[http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/192148]  
专题中国科学院海洋研究所
作者单位1.中国科学院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室
2.中国科学院研究生院
3.中国科学院北京基因组研究所
推荐引用方式
GB/T 7714
王海青,曲艳梅,刘斌. 口虾蛄肠道细菌种群多样性的分子分析. 2010.

入库方式: OAI收割

来源:海洋研究所

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