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基于皱纹盘鲍(Haliotis discus hannai)EST数据库的串联重复序列特征分析

文献类型:CNKI期刊论文

作者袁泽轶; 张琳琳; 张国范
发表日期2010-02-15
出处海洋通报
关键词皱纹盘鲍 EST 串联重复序列 SSR
英文摘要皱纹盘鲍大规模EST的分析研究较少,为了研究其基因组转录本的基本特征并为皱纹盘鲍中开发EST-SSR功能性标记奠定基础,我们利用生物信息学手段对NCBI公共数据库中的5784条皱纹盘鲍EST序列进行EST-SSR特征分析。分析结果表明:(1)皱纹盘鲍EST中串联重复序列类型丰富;(2)皱纹盘鲍EST Gene Ontology注释序列SSR类型单一;(3)皱纹盘鲍EST-SSR分布广泛富,是EST-SSR标记开发的优良资源。
文献子类CNKI期刊论文
资助机构国家重点基础研究发展计划资助(973计划项目,2010CB126401) ; 国家公益性行业(农业)科研专项资助(nyhyzx07-047)
v.29;No.165期:01页:61-66
语种中文;
分类号S917.4
ISSN号1001-6392
源URL[http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/192244]  
专题中国科学院海洋研究所
作者单位1.中国科学院海洋研究所
2.中国科学院研究生院
推荐引用方式
GB/T 7714
袁泽轶,张琳琳,张国范. 基于皱纹盘鲍(Haliotis discus hannai)EST数据库的串联重复序列特征分析. 2010.

入库方式: OAI收割

来源:海洋研究所

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