应用PCR-DGGE技术分析长江口低氧区的细菌群落组成
文献类型：CNKI期刊论文
| 作者 | 刘敏; 王子峰; 朱开玲; 李洪波; 高绪敏; 邓兵; 肖天 |
| 发表日期 | 2008-06-15 |
| 出处 | 高技术通讯
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| 关键词 | 细菌群落组成 16S rDNA序列分析 PCR-DGG 长江口低氧区 |
| 英文摘要 | 应用 PCR 结合变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术对长江口外低氧区的细菌群落组成和优势菌群进行了分析。对25条 DGGE 条带进行了克隆、测序,所得到的细菌16SrDNA 基因 V3区序列进行了系统进化分析。结果显示这25条条带分别归属于4个细菌类群:变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroides)、厚壁菌门(Firmicutes)和蓝细菌门(Cyanobacteria)。其中有16条分别与变形细菌亚群的γ-Proteobacteria 和δ-Proteobacteria 相似。时空分析发现,低氧水体的细菌群落组成与非低氧水体的组成不同,低氧水体包括变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroides)、厚壁菌门(Firmicutes)和蓝细菌门(Cyanobac-teria),非低氧水体中没有发现蓝细菌门(Cyanobacteria)。并且8月份低氧水体中 Flavobac-teria 为优势菌群。 |
| 文献子类 | CNKI期刊论文 |
| 资助机构 | 973计划(2006CB400604) ; 国家自然科学基金(40376048) ; 中国科学院研究生院科学与社会实践资助专项(创新研究类)资助 |
| 卷 | v.18;No.210期:06页:104-110 |
| 语种 | 中文; |
| 分类号 | Q93 |
| ISSN号 | 1002-0470 |
| 源URL | [http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/192953]  |
| 专题 | 中国科学院海洋研究所 |
| 作者单位 | 1.中国科学院海洋研究所海洋生态与环境科学重点实验室 2.中国科学院研究生院 3.国家海洋环境监测中心 4.华东师范大学河口海岸国家重点实验室 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 刘敏,王子峰,朱开玲,等. 应用PCR-DGGE技术分析长江口低氧区的细菌群落组成. 2008. |
入库方式： OAI收割
来源：海洋研究所
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