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耐高温酸性α-淀粉酶基因部分序列的克隆与分析

文献类型:CNKI期刊论文

作者王淑军; 邓祥元; 李富超; 秦松; 陆兆新
发表日期2007-12-09
出处海洋科学
关键词高温球菌 α-淀粉酶 基因克隆 序列分析
英文摘要利用已报道的α-淀粉酶基因序列的保守区域设计引物,通过聚合酶链式反应(PCR)获得了高温球菌Thermococcus sp. HJ21的耐高温酸性α-淀粉酶基因的部分序列。通过对该序列的同源性比较分析发现,高温球菌Thermococcus sp. HJ21与热水高温球菌Thermococcus hydrothermalis和Thermococcus sp. OGL-20P的亲缘关系最近,序列相似度达到95%以上;利用Swiss Model预测该基因产物的3级结构,显示其具有典型的(β/α)8桶状结构;通过分析密码子的使用情况得知,该α-淀粉酶存在着密码子的兼并性和使用的偏向性问题。
文献子类CNKI期刊论文
资助机构中国科学院知识创新工程重要方向项目(KZCX3-SW-223,KZCX2-YW-209) ; 江苏省“六大人才高峰”第三批资助项目(06-A-017) ; 江苏省教育厅自然科学基金项目(06KJB550004)
No.222期:12页:71-77+96
语种中文;
分类号Q78
ISSN号1000-3096
源URL[http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/197823]  
专题中国科学院海洋研究所
作者单位南京农业大学食品科技学院,中国科学院海洋研究所,中国科学院海洋研究所,中国科学院海洋研究所,南京农业大学食品科技学院江苏南京210095,淮海工学院,江苏省海洋生物技术重点建设实验室江苏连云港222005,山东青岛266071,山东青岛266071,山东青岛266071,江苏南京210095
推荐引用方式
GB/T 7714
王淑军,邓祥元,李富超,等. 耐高温酸性α-淀粉酶基因部分序列的克隆与分析. 2007.

入库方式: OAI收割

来源:海洋研究所

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