五种/株原甲藻核糖体小亚基(18S rRNA)基因克隆及序列分析
文献类型:CNKI期刊论文
作者 | 王波; 米铁柱; 吕颂辉; 孙军; 李秀芹; 甄毓; 李荣秀; 于志刚 |
发表日期 | 2006-09-30 |
出处 | 海洋与湖沼
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关键词 | 原甲藻属 18S rRNA基因 系统分析 |
英文摘要 | 采用分子克隆及序列比对的方法,对五种/株赤潮原甲藻18SrRNA基因全长序列进行扩增、克隆和序列测定,并从GenBank上下载13个原甲藻18SrRNA基因接近全长的序列,用NJ法和ME法构建了原甲藻属的系统树。结果表明,五种/株原甲藻18SrRNA基因扩增序列长度为1782—1783bp,其中来自南海(中国海域)和来自美国海域的两株微小原甲藻(Prorocentrumminimum)的序列完全一致;东海的赤潮原甲藻(Prorocentrumsp·)与具齿原甲藻(P·dentatum)的序列也完全一致,与微小原甲藻只有5个碱基的差异;而海洋原甲藻(P·micans)与微小原甲藻和具齿原甲藻的序列差异较大,分别为27个和28个碱基。通过NJ法和ME法构建的系统树基本一致。由系统树可以看到:原甲藻属大致分为两支,本实验的微藻全部分布在同一支上。18SrRNA基因序列还将有助于有害赤潮藻快速鉴定的特异性分子探针的研制。 |
文献子类 | CNKI期刊论文 |
资助机构 | 国家高技术研究发展计划(863计划)项目,2001AA635090号 ; 国家重点基础研究发展规划(973)项目,2001CB409704号 ; 山东省优秀中青年科学家科研奖励基金,01BS08号 |
期 | 05页:68-74 |
语种 | 中文; |
分类号 | X173;Q943.2 |
ISSN号 | 0029-814X |
源URL | [http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/198531] ![]() |
专题 | 中国科学院海洋研究所 |
作者单位 | 1.青岛266071 2.上海200030 3.暨南大学水生生物研究所 4.中国海洋大学 5.上海交通大学 6.中国科学院海洋研究所 7.暨南大学水生生物研究所青岛266003 8.青岛266003 9.广州510632 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 王波,米铁柱,吕颂辉,等. 五种/株原甲藻核糖体小亚基(18S rRNA)基因克隆及序列分析. 2006. |
入库方式: OAI收割
来源:海洋研究所
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