三株赤潮硅藻5.8S rDNA及转录间隔区(ITS)的克隆及序列分析
文献类型：CNKI期刊论文
| 作者 | 张宝玉; 王广策; 吕颂辉; 齐雨藻; 邹景忠; 曾呈奎 |
| 发表日期 | 2006-01-30 |
| 出处 | 海洋学报(中文版)
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| 关键词 | 硅藻 尖刺拟菱形藻 ITS 序列分析 系统进化 |
| 英文摘要 | 对引发赤潮的3株硅藻———1株尖刺拟菱形藻(Pseudo-nitzshia pungens)和2株中肋骨条藻(Skeletonema costatum)的5.8S rDNA和ITS(internal transcribed spacers)序列进行了PCR扩增、克隆和序列测定,并分析了硅藻门10株赤潮藻(7株从GenBank获得)的系统进化关系.研究结果表明,尖刺拟菱形藻的ITS和5.8S rDNA的长度为693bp,SK-1(分离自东海赤潮暴发区)测序得到715bp,除ITS和5.8SrDNA外,还包含部分18S rDNA和28S rDNA;SK-2(分离自青岛养殖场)的ITS和5.8S rDNA的长度为331bp,尖刺拟菱形藻与从GenBank中获得的2株尖刺拟菱形藻相似程度最高,为100%,与该属的多列拟菱形藻相似程度稍低,为82.9%.SK-2的ITS序列与SK-1的相似程度很低,只有51%,但与拟中肋骨条藻的ITS序列相似程度高,为95.5%.SK-1的ITS序列与拟中肋骨条藻的相似程度也低,为56.7%.系统进化树反映的结果与相似性反映的结果一致.研究的该株尖刺拟菱形藻从根据ITS序列研究的结果与形态鉴定的结果看是一致的;SK-2可能属于拟中肋骨条藻;SK-1比较特殊,有待于用其他的方法进一步研究确定其分类地位. |
| 文献子类 | CNKI期刊论文 |
| 资助机构 | 国家自然科学基金资助项目(30170499) ; 中国科学院知识创新重要方向性资助项目(KZCX2-211) ; “973”项目“我国赤潮高发区赤潮生物多样性及其种群分布特征”资助项目(2001CB409701) |
| 期 | 01页:113-119 |
| 语种 | 中文; |
| 分类号 | X173 |
| ISSN号 | 0253-4193 |
| 源URL | [http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/198795]  |
| 专题 | 中国科学院海洋研究所 |
| 作者单位 | 1.中国科学院海洋研究所 2.暨南大学水生生物研究所 3.中国科学院海洋研究所山东青岛266071中国科学院研究生院 4.北京100089 5.山东青岛266071 6.广东广州510632 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 张宝玉,王广策,吕颂辉,等. 三株赤潮硅藻5.8S rDNA及转录间隔区(ITS)的克隆及序列分析. 2006. |
入库方式： OAI收割
来源：海洋研究所
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