沙棘MBF1基因家族鉴定及铅胁迫下表达分析
文献类型：期刊论文
| 作者 | 任乾丹; 李昕娟; 张恬; 陈科; 孙菁; 周武 |
| 刊名 | 西南农业学报
 |
| 出版日期 | 2025 |
| 卷号 | 38期号:04页码:703-714 |
| 关键词 | 沙棘 MBF1基因家族 重金属胁迫 生物信息学 表达分析 |
| 英文摘要 | 【目的】从全基因组水平鉴定沙棘MBF1基因家族成员，分析其基因表达模式，为后续研究MBF1基因家族响应重金属铅胁迫相关作用机制奠定理论基础。【方法】利用生物信息学方法鉴定沙棘MBF1基因家族成员并对其编码蛋白的理化性质、亚细胞和染色体定位、顺式作用元件等进行分析，通过转录组和RT-qPCR分析其在Pb胁迫下的表达模式。【结果】在沙棘中共鉴定出6个MBF1基因家族成员，分别命名为HrMBF1-1～HrMBF1-6,HrMBF1基因编码蛋白质的氨基酸数为110～144 aa;分子量为12 441.43～16 002.43 Da;等电点为9.91～10.18,为碱性蛋白；不稳定指数为34.72～60.07,其中HrMBF1-1、HrMBF1-3、HrMBF1-4为稳定蛋白，HrMBF1-2、HrMBF1-5、HrMBF1-6为不稳定蛋白；脂肪族指数为79.15～89.55;平均亲水系数为-0.645～0.845,均小于0,因此6个沙棘HrMBF1蛋白家族成员均为亲水性蛋白；HrMBF1蛋白的二级结构主要包括α-螺旋、β-折叠、转角以及无规则卷曲；染色体定位显示6个HrMBF1基因不均匀分布在5条染色体上；系统发育分析将沙棘MBF1基因家族分为2个类群，Group I包括HrMBF1-1、HrMBF1-3和HrMBF1-4,定位于细胞核；Group II包括HrMBF1-2、HrMBF1-5和HrMBF1-6,定位于细胞质；结构域分析结果表明，除了HrMBF1-2基因只有aMBF1结构域，其余HrMBF1基因家族成员有MBF1和aMBF1 2种结构域；沙棘MBF1基因含有7个保守基序；沙棘MBF1基因含有与热、干旱和生长等非生物胁迫相关的顺式作用元件；复制事件分析显示有4对沙棘MBF1基因存在重复片段；沙棘与拟南芥、毛果杨之间存在种间共线性关系；转录组和RT-qPCR验证显示，随着胁迫Pb离子浓度的增加，除了HrMBF1-2基因，其余5个MBF1基因家族成员的表达量总体呈先上升后下降再上升趋势。【结论】沙棘MBF1基因家族成员在应对Pb胁迫时发挥重要作用。 |
| 源URL | [http://ir.nwipb.ac.cn/handle/363003/62602]  |
| 专题 | 西北高原生物研究所_中国科学院西北高原生物研究所 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 任乾丹,李昕娟,张恬,等. 沙棘MBF1基因家族鉴定及铅胁迫下表达分析[J]. 西南农业学报,2025,38(04):703-714. |
| APA | 任乾丹,李昕娟,张恬,陈科,孙菁,&周武.(2025).沙棘MBF1基因家族鉴定及铅胁迫下表达分析.西南农业学报,38(04),703-714. |
| MLA | 任乾丹,et al."沙棘MBF1基因家族鉴定及铅胁迫下表达分析".西南农业学报 38.04(2025):703-714. |
入库方式： OAI收割
来源：西北高原生物研究所
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