利用生物信息学方法寻找作物中潜在的胞外ATP受体蛋白质
文献类型：期刊论文
| 作者 | 桑鹤天; 张悦婧; 石珍珍; 冯汉青 |
| 刊名 | 兰州大学学报(自然科学版)
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| 出版日期 | 2025 |
| 卷号 | 61期号:01页码:76-83 |
| 关键词 | 生物信息学 胞外ATP受体 蛋白质亲缘分析 |
| 英文摘要 | 为分析作物中的胞外ATP受体蛋白质,通过NCBI数据库获取拟南芥外ATP受体蛋白质L-型凝集素受体样激酶1.9(lecRK-1.9)和L-型凝集素受体样激酶1.5(lecRK-1.5)的氨基酸序列,通过BLAST比对和同源树构建,以油菜和玉米为例,在两种作物中筛选与lecRK-1.9和lecRK-1.5亲缘关系相近的蛋白质;使用ExPASy ProtParam、 Cell-PLoc、 MEME等工具对这些蛋白质进行理化分析、亚细胞定位和二级结构预测.结果显示,油菜、玉米中的12个候选蛋白质的理论等电点为6.52～8.91,大多为疏水蛋白质; 12个蛋白质中有6个蛋白质在质膜上具有定位, 12个蛋白质二级结构比例均与拟南芥lecRK-1.9、 lecRK-1.5相似,其中有8个蛋白质在保守结构域的位置及顺序上与拟南芥lecRK-1.9、lecRK-1.5具有较高的相似性.这些在油菜、玉米中与拟南芥lecRK-1.9、 lecRK-1.5蛋白质在理化性质、亚细胞定位、二级结构以及保守结构域具有高相似性的蛋白质,可作为油菜、玉米中胞外ATP受体蛋白质的参选蛋白质. |
| 源URL | [http://ir.nwipb.ac.cn/handle/363003/62637]  |
| 专题 | 西北高原生物研究所_中国科学院西北高原生物研究所 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 桑鹤天,张悦婧,石珍珍,等. 利用生物信息学方法寻找作物中潜在的胞外ATP受体蛋白质[J]. 兰州大学学报(自然科学版),2025,61(01):76-83. |
| APA | 桑鹤天,张悦婧,石珍珍,&冯汉青.(2025).利用生物信息学方法寻找作物中潜在的胞外ATP受体蛋白质.兰州大学学报(自然科学版),61(01),76-83. |
| MLA | 桑鹤天,et al."利用生物信息学方法寻找作物中潜在的胞外ATP受体蛋白质".兰州大学学报(自然科学版) 61.01(2025):76-83. |
入库方式： OAI收割
来源：西北高原生物研究所
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