MOLMAP指数及其在变异性预测中的应用
文献类型：期刊论文
| 作者 | 张庆友 ; 龙海林 ; 冯秀林 ; 索净洁 ; 张丹丹 ; 李静亚 ; 许力壮 ; 许禄 |
| 刊名 | 物理化学学报
 |
| 出版日期 | 2012 |
| 卷号 | 28期号:3页码:541-546 |
| 关键词 | 分子映射指数 Kohonen自组织映射 随机森林 诱变性 结构-活性关系 |
| ISSN号 | 1000-6818 |
| 通讯作者 | 许禄 |
| 中文摘要 | 分子映射(MOLMAP)指数是以分子的化学键描述符为基础, 通过Kohonen自组织映射依据一定的算法而衍生. 化学键描述符是由化学键的物理化学性质, 如两端原子的电荷差和拓扑性质, 键连杂原子数量等所组成. 本文将分子映射指数应用于4075个有机物质(Ames实验结果: 2305个结构有诱变性, 1770个结构无诱变性)的变异性预测. 通过随机森林, 分别采用三种类型的指数建立模型: (1)采用不同维数的分子映射指数;(2)采用全局分子描述符;(3)将分子映射指数与全局分子描述符相结合. 整个数据集的集外(out-of-bag)交叉验证的正确预测率达到85.4%. 为了检验模型的稳定性, 采用所建模型预测源于另一数据库的472个化合物, 正确预测率为86.7%, 与此前的研究相比, 两个预测结果均有所提高. |
| 收录类别 | CSCD收录国内期刊论文 |
| 语种 | 中文 |
| 公开日期 | 2013-11-17 |
| 源URL | [http://ir.ciac.jl.cn/handle/322003/49149]  |
| 专题 | 长春应用化学研究所_长春应用化学研究所知识产出_期刊论文 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 张庆友,龙海林,冯秀林,等. MOLMAP指数及其在变异性预测中的应用[J]. 物理化学学报,2012,28(3):541-546. |
| APA | 张庆友.,龙海林.,冯秀林.,索净洁.,张丹丹.,...&许禄.(2012).MOLMAP指数及其在变异性预测中的应用.物理化学学报,28(3),541-546. |
| MLA | 张庆友,et al."MOLMAP指数及其在变异性预测中的应用".物理化学学报 28.3(2012):541-546. |
入库方式： OAI收割
来源：长春应用化学研究所
浏览0
下载0
收藏0
其他版本
除非特别说明，本系统中所有内容都受版权保护，并保留所有权利。