竹亚科叶绿体DNA条形码筛选
文献类型:期刊论文
作者 | 张玉霄 ; 许宇星 ; 马朋飞 ; 张丽娜 ; 李德铢* |
刊名 | 植物分类与资源学报
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出版日期 | 2013 |
期号 | 6页码:743-750 |
关键词 | 竹亚科 DNA条形码 插入/缺失 分子系统学 叶绿体片段筛选 |
ISSN号 | 2095-0845 |
产权排序 | 第一 |
中文摘要 | 竹亚科是一个形态上鉴定困难且易于混淆的类群。DNA条形码技术为这一类群的鉴定提供了一个辅助手段。核心条形码(rbcL+matK)在竹亚科中的鉴别率很低,因此,有必要针对竹亚科筛选有效的DNA条形码片段。本研究根据已发表的竹亚科叶绿体基因组序列,筛选出16个片段,包括1个基因片段和15个基因间隔区,选取青篱竹族和箣竹族的10属22种30个个体,进行引物通用性、测序成功率和变异位点分析。研究结果表明:(1)引物具有较高的扩增成功率,但部分片段中由于存在poly结构造成测序失败;(2)片段中的插入/缺失可以编码,作为信息位点;(3)trnG-trnT(t)具有最多变异位点,建议可作为竹亚科优先选择的DNA条形码;(4)在开展不同类群的DNA条形码和分子系统学研究时,可以按照"trnG-trnT(t)+X"的方式选择合适的叶绿体DNA片段。 |
语种 | 中文 |
公开日期 | 2014-04-09 |
源URL | [http://ir.kib.ac.cn/handle/151853/17918] ![]() |
专题 | 昆明植物研究所_中国西南野生生物种质资源库 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 张玉霄,许宇星,马朋飞,等. 竹亚科叶绿体DNA条形码筛选[J]. 植物分类与资源学报,2013(6):743-750. |
APA | 张玉霄,许宇星,马朋飞,张丽娜,&李德铢*.(2013).竹亚科叶绿体DNA条形码筛选.植物分类与资源学报(6),743-750. |
MLA | 张玉霄,et al."竹亚科叶绿体DNA条形码筛选".植物分类与资源学报 .6(2013):743-750. |
入库方式: OAI收割
来源:昆明植物研究所
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