纯培养节旋藻全基因组提取方法的比较研究
文献类型：期刊论文
| 作者 | 李善策 ; 李勇勇 ; 夏金兰 ; 秦松 |
| 刊名 | 海洋科学
 |
| 出版日期 | 2013 |
| 卷号 | 37期号:9页码:28-36 |
| 关键词 | 钝顶节旋藻(Arthrospira platensis) 全基因组提取 PCR 16S rRNA-ITS |
| ISSN号 | 1000-3096 |
| 其他题名 | Comparative investigation on whole genome DNA extraction of axenic strains of Athrospira platensis |
| 产权排序 | 中南大学资源加工与生物工程学院;曲阜师范大学化学与化工学院;中国科学院烟台海岸带研究所; |
| 通讯作者 | 秦松, E-mail: sqin@yic.ac.cn |
| 中文摘要 | 本研究从实验室保藏的节旋藻(Arthrospira)藻种出发,挑取形态不同的单藻丝体进行纯化培养,采用6种方法进行全基因组DNA提取的比较研究,而后以16S rRNA-ITS区基因作为分子标记对藻株进行相关序列测定和分子系统进化分析。结果表明,冻融CTAB法能够提取出包含染色体外DNA在内的节旋藻全基因组,高质量样品可以满足分子生物学实验要求;分子系统研究表明,纯化藻株皆为钝顶节旋藻,节旋藻与螺旋藻在分子鉴定中属间差异明显。 |
| 英文摘要 | Single filaments of Arthrospira/Spirulina strains were picked up and axenicly cultured. Six protocols for ex-traction of whole genome DNA of the Arthrospira strains were comparatively studied. The phylogenetic analysis of 16S rRNA-ITS （internally transcribed spacer） gene sequences as molecular markers were conducted. The results show that the method of Freezing-thawing CTAB was effective in extracting extra-genomic DNA, not chromasomal from the tested strains. The extracted DNA containing excellent overall quality and high molecular weight can be directly used for molecular biology experiments. The molecular phylogenetic dendrogram indicates that the strains used in this research were all Arthrospira platensis, which were significantly different from strains of Spirulina in molecu-lar classification and identification in cyanobacterial genus. |
| 学科主题 | 环境污染及其防治 |
| 收录类别 | CSCD |
| 资助信息 | 海洋公益性行业科研专项经费资助项目(200905021-3,201205027);; 山东省自然科学基金项目(ZR2012DQ015);; 广东省中国科学院全面战略合作项目(2011A090100040) |
| 语种 | 中文 |
| CSCD记录号 | CSCD:4984232 |
| 公开日期 | 2014-07-07 |
| 源URL | [http://ir.yic.ac.cn/handle/133337/6879]  |
| 专题 | 烟台海岸带研究所_海岸带生物学与生物资源利用所重点实验室 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 李善策,李勇勇,夏金兰,等. 纯培养节旋藻全基因组提取方法的比较研究[J]. 海洋科学,2013,37(9):28-36. |
| APA | 李善策,李勇勇,夏金兰,&秦松.(2013).纯培养节旋藻全基因组提取方法的比较研究.海洋科学,37(9),28-36. |
| MLA | 李善策,et al."纯培养节旋藻全基因组提取方法的比较研究".海洋科学 37.9(2013):28-36. |
入库方式： OAI收割
来源：烟台海岸带研究所
浏览0
下载0
收藏0
其他版本
除非特别说明，本系统中所有内容都受版权保护，并保留所有权利。