基于中国明对虾不同组织EST数据的基因表达差异分析
文献类型:期刊论文
作者 | 隗健凯![]() ![]() |
刊名 | 水产学报
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出版日期 | 2013-05-15 |
期号 | 5页码:661-671 |
关键词 | 中国明对虾 表达序列标签(EST) 组织差异 组织高表达基因 |
中文摘要 | 对前期获得的中国明对虾头胸部、血液、眼柄、卵巢4种组织的EST测序数据进行了生物信息学挖掘和分析。4种组织的原始EST序列分别为10 446条、2 690条、1 067条和1 282条,通过聚类拼接得到unigene 3 454条、1 053条、406条和544条,对其进行了NR、GO、KEGG等数据库的功能注释,并在此基础上进行了组织差异分析。通过同源比对的方法找出了各组织特异的转录本,并根据注释信息将其进行了GO功能分类。结果显示,血液组在细胞杀伤、迁移和节律等功能分类上特异性富集;眼柄组在色素生成、信号传递和生物学调控等功能分类上特异性富集;卵巢组在营养贮存运输、繁殖和定位等功能分类上特... |
公开日期 | 2014-07-28 |
源URL | [http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/16830] ![]() |
专题 | 海洋研究所_实验海洋生物学重点实验室 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 隗健凯,相建海. 基于中国明对虾不同组织EST数据的基因表达差异分析[J]. 水产学报,2013(5):661-671. |
APA | 隗健凯,&相建海.(2013).基于中国明对虾不同组织EST数据的基因表达差异分析.水产学报(5),661-671. |
MLA | 隗健凯,et al."基于中国明对虾不同组织EST数据的基因表达差异分析".水产学报 .5(2013):661-671. |
入库方式: OAI收割
来源:海洋研究所
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