海水养殖病鱼分离菌株的分类和抗生素抗性及抗性基因检测
文献类型：学位论文
| 作者 | 兰欣 |
| 学位类别 | 硕士 |
| 答辩日期 | 2013-05 |
| 授予单位 | 中国科学院研究生院 |
| 导师 | 莫照兰 |
| 关键词 | 分类地位 16S rRNA 系统发育学分析 抗生素抗性基因 整合子 |
| 学位专业 | 海洋生物学 |
| 中文摘要 | 细菌性疾病是我国海水养殖鱼类的主要病害，细菌的抗生素耐药成为环境和食品安全的重要问题。本研究对1999年-2012年从山东、江苏、河北、天津等沿海地区养殖场发病鱼分离得到进行细菌菌株分类地位、抗生素抗性及抗性基因的分析，获得我国北方海水养殖鱼类的可疑细菌病原种类及耐药信息，为疾病控制、提高水产品质量提供理论指导。 1. 分离菌株的分类地位。对124株菌进行了16S rRNA基因序列和系统发育学的分析。对菌株进行16S rRNA基因序列的扩增和测序，得到的序列与GenBank核酸序列数据库进行相似性比对分析，结果显示有83株为弧菌属（Vibrio sp.）细菌，11株为气单胞菌属（Aeromonas sp.）细菌，4株为爱德华氏菌属（Edwardsiella sp.）细菌， 3株为假单胞菌（Pseudomonas sp.）属细菌，3株为假交替单胞菌属（Pseudoalteromonas sp.）细菌，20株为其他13种属的细菌。根据系统发育学分析结果，进一步将77株菌鉴定为18个种，优势种为溶藻弧菌（V. alginolyticus），哈氏弧菌（V. harveyi），鳗弧菌（V. anguillarum），杀鲑气单胞菌（A. salmonicida），迟缓爱德华氏菌（E. tarda）。 2. 分离菌株的耐药性。对230菌株进行了6种抗生素（氨苄青霉素、氯霉素、环丙沙星、呋喃唑酮、利福平和四环素）耐药性的检测。结果显示，氨苄青霉素抗性菌株149，占64.8%；氯霉素的耐药菌株数为29（12.3%）；环丙沙星的耐药菌株数为20(8.5%)；呋喃唑酮的耐药菌株数为113(48.1%)；利福平的耐药菌株数为8(3.4%)；四环素的耐药菌株数为24(10.2%)。对二种抗生素耐药的菌株为85 (37.0%)，对三种抗生素耐药的菌株为18（7.8%），对四种抗生素耐药的菌株为12（5.2%）。 3. 耐药基因和整合子检测。运用多重PCR的方法分析氯霉素抗性菌株-cat基因和四环素抗性菌株-tet基因的分布特征。结果显示：29株氯霉素抗性菌株中含有catⅠ基因的为41.4%（12株），含有catⅡ基因的为38%（11株），含有catⅢ基因的为13.8%（4株），未检测到catⅣ基因，另外有2株未扩增出目的条带，没有菌株同时携带两个或两个以上的cat基因；24株四环素抗性菌株中主要存在的tet基因是tetB（75%），tetC（16.7%）和tetE（8.3%），有1株菌携带有两种tet基因，为tetC和tetD。 整合子是造成细菌多耐药性的主要原因，对230株已完成药敏实验的菌株进行了Ⅰ型和Ⅱ型整合子的检测，6株菌含有Ⅰ型整合子，其中1株同时含有Ⅰ型和Ⅱ型整合子，有4个菌株含有Ⅰ型整合子的多个不同克隆。这些整合子主要主要编码抗生素抗性基因、转运蛋白或通透酶等。 |
| 语种 | 中文 |
| 公开日期 | 2014-08-08 |
| 源URL | [http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/17764]  |
| 专题 | 海洋研究所_实验海洋生物学重点实验室 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 兰欣. 海水养殖病鱼分离菌株的分类和抗生素抗性及抗性基因检测[D]. 中国科学院研究生院. 2013. |
入库方式： OAI收割
来源：海洋研究所
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