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基于分子网络的癌症基因与非癌症基因的差异性分析

文献类型:期刊论文

作者聂亚玲 ; 余景开
刊名山东大学学报(理学版)
出版日期2012
期号07页码:6-9+29
关键词蛋白质相互作用 癌症基因 节点度 介数 最大连接组件
中文摘要研究人类蛋白质相互作用网络中,癌症基因和非癌症基因在拓扑结构上的差异性,进而为潜在的癌症基因挖掘提供重要依据。首先利用多个数据库,构建一个较为全面的人类蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,并搜集已知癌症基因;然后从PPI网络中抽取大量随机样本,并分别统计分析随机样本和已知癌症基因在节点度、节点介数和最大连接组件上的差异程度。得到了如下结果:(1)构建了一个较为全面的人类蛋白质相互作用网络;(2)获得乳腺癌已知癌症基因集;(3)已知癌症基因集和PPI网络随机样本在节点度、节点介数以及最大连接组件等拓扑结构属性上差异有显著性(P<2.2×10-16)。PPI网络的节点度、节点介数和最大连接组件等拓扑结构属性能够显著地区分癌症基因与非癌症相关基因,为新的未知癌症基因的发掘提供了重要考察依据。
公开日期2014-08-27
版本出版稿
源URL[http://ir.ipe.ac.cn/handle/122111/10268]  
专题过程工程研究所_研究所(批量导入)
推荐引用方式
GB/T 7714
聂亚玲,余景开. 基于分子网络的癌症基因与非癌症基因的差异性分析[J]. 山东大学学报(理学版),2012(07):6-9+29.
APA 聂亚玲,&余景开.(2012).基于分子网络的癌症基因与非癌症基因的差异性分析.山东大学学报(理学版)(07),6-9+29.
MLA 聂亚玲,et al."基于分子网络的癌症基因与非癌症基因的差异性分析".山东大学学报(理学版) .07(2012):6-9+29.

入库方式: OAI收割

来源:过程工程研究所

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