子结构检索中关系数据库插件的使用和效率
文献类型：期刊论文
| 作者 | 王玉玲 ; 吴昊 ; 温浩 |
| 刊名 | 计算机与应用化学
 |
| 出版日期 | 2011 |
| 期号 | 11页码:1419-1423 |
| 关键词 | 分子结构数据库子结构检索 关系数据库插件 预筛选 |
| 中文摘要 | 采用关系数据库插件能够实现化合物描述符(FingerPrint)的生成、建立索引和化合物的子结构检索。本文以PubChem有机化合物Molfile为数据源,在Oracle关系数据库上分别安装插件OrChem(JAVA)和Bingo(C~(++))构建了化合物分子结构数据库。本文从FingerPrint的构成和索引策略两方面讨论了OrChem和Bingo的主要差异,并选取10个特征化合物进行子结构检索测试。对存储40万种化合物的分子结构数据库的测试结果显示,OrChem可满足用户检索响应,Bingo则更为快捷。对于存储2600万种化合物的分子结构数据库,针对Bingo通过优化Oracle数据库内存管理、数据表结构、子结构预筛选参数,实现了满足用户的高效检索。 |
| 公开日期 | 2014-08-27 |
| 版本 | 出版稿 |
| 源URL | [http://ir.ipe.ac.cn/handle/122111/10499]  |
| 专题 | 过程工程研究所_研究所（批量导入） |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 王玉玲,吴昊,温浩. 子结构检索中关系数据库插件的使用和效率[J]. 计算机与应用化学,2011(11):1419-1423. |
| APA | 王玉玲,吴昊,&温浩.(2011).子结构检索中关系数据库插件的使用和效率.计算机与应用化学(11),1419-1423. |
| MLA | 王玉玲,et al."子结构检索中关系数据库插件的使用和效率".计算机与应用化学 .11(2011):1419-1423. |
入库方式： OAI收割
来源：过程工程研究所
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