Particle-Mesh Ewald(PME)算法的GPU加速
文献类型：期刊论文
| 作者 | Xu J(徐骥); Ge Y(葛蔚); Ren Y(任瑛); Li JH(李静海) |
| 刊名 | 计算物理
 |
| 出版日期 | 2010 |
| 期号 | 04页码:548-554 |
| 关键词 | PME(Particle-Mesh Ewald)加速 GPU(Graphic Processing Unit图形处理单元) CUDA(Compute Unified Device Architecture计算统一设备架构) |
| 中文摘要 | 讨论在NVIDIACUDA开发环境下,用GPU加速分子动力学模拟中静电作用的长程受力计算部分.采用Particle-Mesh Ewald(PME)方法,将其分解为参数确定、点电荷网格离散、离散网格的傅立叶变换、静电热能求解与静电力求解5个部分,并分别分析各部分的GPU实现.此方法已成功用于7个不同大小的生物分子体系的模拟计算,达到了7倍左右的加速.该程序可耦合到现有分子动力学模拟软件中,或作为进一步开发的GPU分子动力学程序的一部分,显著加速传统分子动力学程序. |
| 收录类别 | CSCD |
| 公开日期 | 2014-08-27 |
| 源URL | [http://ir.ipe.ac.cn/handle/122111/10576]  |
| 专题 | 过程工程研究所_研究所（批量导入） |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | Xu J(徐骥),Ge Y(葛蔚),Ren Y(任瑛),等. Particle-Mesh Ewald(PME)算法的GPU加速[J]. 计算物理,2010(04):548-554. |
| APA | Xu J,Ge Y,Ren Y,&Li JH.(2010).Particle-Mesh Ewald(PME)算法的GPU加速.计算物理(04),548-554. |
| MLA | Xu J,et al."Particle-Mesh Ewald(PME)算法的GPU加速".计算物理 .04(2010):548-554. |
入库方式： OAI收割
来源：过程工程研究所
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