利用高通量测序分析青藏高原地区青杨的SSR和SNP特征
文献类型：期刊论文
| 作者 | 雷淑芸 ; 张发起 ; Khan Gulzar ; 王久利 ; 刘海瑞 ; 陈世龙 |
| 刊名 | 林业科学研究
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| 出版日期 | 2015 |
| 期号 | 1页码:37-43 |
| 关键词 | 青杨 青藏高原 高通量测序 微卫星 单核苷酸多态性 |
| 中文摘要 | 利用Illumina Hi SeqTM2000平台对采自青海玉树的青杨进行高通量测序,SSR分析共获得7 067条SSR序列,复合型SSR共525条,发生频率0.149,平均跨度4 531.87 bp。SSR重复类型中,单核苷酸重复类型最多(33.96%);三核苷酸重复类型次之(31.00%);二核苷酸重复类型位居第三(27.69%);四核苷酸、五核苷酸、六核苷酸重复类型SSR含量很少(<8%)。二核苷酸重复类型中,AG重复类型所占比例最高,GA次之,CT、TC则紧随其后;三核苷酸重复类型中,AAG重复类型所占比例最高,GAA次之,TTC、AGA、GAG、CAG、TCT、TGG等重复类型数量相... |
| 源URL | [http://ir.nwipb.ac.cn/handle/363003/5390]  |
| 专题 | 西北高原生物研究所_中国科学院西北高原生物研究所 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 雷淑芸,张发起,Khan Gulzar,等. 利用高通量测序分析青藏高原地区青杨的SSR和SNP特征[J]. 林业科学研究,2015(1):37-43. |
| APA | 雷淑芸,张发起,Khan Gulzar,王久利,刘海瑞,&陈世龙.(2015).利用高通量测序分析青藏高原地区青杨的SSR和SNP特征.林业科学研究(1),37-43. |
| MLA | 雷淑芸,et al."利用高通量测序分析青藏高原地区青杨的SSR和SNP特征".林业科学研究 .1(2015):37-43. |
入库方式： OAI收割
来源：西北高原生物研究所
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