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近代物理研究所 578 理论物理研究所 343 高能物理研究所 343
力学研究所 198 数学与系统科学研究院 183 物理研究所 164
金属研究所 147 地质与地球物理研究所 124 紫金山天文台 95
上海应用物理研究所 93 武汉物理与数学研究所 90 地理科学与资源研究所 84
自动化研究所 81 过程工程研究所 79 半导体研究所 79
国家天文台 68 大连化学物理研究所 67 上海光学精密机械研究所 66
沈阳自动化研究所 57 地球化学研究所 55 化学研究所 54
新疆天文台 45 云南天文台 45 长春应用化学研究所 42
广州能源研究所 39 武汉岩土力学研究所 37 合肥物质科学研究院 35
中国科学院大学 32 国家空间科学中心 30 长春光学精密机械与物理研究所 27
西安光学精密机械研究所 22 上海天文台 21 水土保持研究所 20
上海微系统与信息技术研究所 19 寒区旱区环境与工程研究所 18 水生生物研究所 15
心理研究所 14 工程热物理研究所 14 深圳先进技术研究院 13
成都山地灾害与环境研究所 13 遥感与数字地球研究所 12 软件研究所 12
烟台海岸带研究所 12 深海科学与工程研究所 11 生态环境研究中心 10
青岛生物能源与过程研究所 7 海洋研究所 7 重庆绿色智能技术研究院 7
南海海洋研究所 6 宁波材料技术与工程研究所 6 上海药物研究所 6
兰州化学物理研究所 6 新疆生态与地理研究所 5 西双版纳热带植物园 5
武汉植物园 5 地球环境研究所 5 植物研究所 5
青海盐湖研究所 4 上海硅酸盐研究所 4 计算技术研究所 3
广州地球化学研究所 3 兰州油气资源研究中心 3 沈阳应用生态研究所 3
新疆理化技术研究所 2 昆明植物研究所 2 计算机网络信息中心 2
昆明动物研究所 2 国家授时中心 2 山西煤炭化学研究所 1
自然科学史研究所 1 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 1 福建物质结构研究所 1
成都生物研究所 1 西北高原生物研究所 1 南京土壤研究所 1
上海技术物理研究所 1 古脊椎动物与古人类研究所 1