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西北高原生物研究所 1301 自动化研究所 1210 过程工程研究所 1175
地理科学与资源研究所 997 高能物理研究所 667 大连化学物理研究所 662
生态环境研究中心 643 烟台海岸带研究所 376 沈阳自动化研究所 341
长春应用化学研究所 340 遥感与数字地球研究所 334 西安光学精密机械研究所 333
地质与地球物理研究所 313 近代物理研究所 288 合肥物质科学研究院 281
上海药物研究所 258 兰州化学物理研究所 233 深圳先进技术研究院 231
长春光学精密机械与物理研究所 209 上海应用物理研究所 196 化学研究所 191
计算技术研究所 167 上海有机化学研究所 160 海洋研究所 155
中国科学院大学 154 成都山地灾害与环境研究所 142 西双版纳热带植物园 133
沈阳应用生态研究所 114 半导体研究所 112 金属研究所 110
青岛生物能源与过程研究所 109 宁波材料技术与工程研究所 108 青海盐湖研究所 108
软件研究所 108 地球化学研究所 104 上海光学精密机械研究所 102
广州能源研究所 100 地球环境研究所 99 新疆理化技术研究所 93
植物研究所 93 武汉岩土力学研究所 92 水生生物研究所 91
物理研究所 89 昆明植物研究所 89 心理研究所 88
声学研究所 81 重庆绿色智能技术研究院 75 南京土壤研究所 74
力学研究所 70 上海硅酸盐研究所 62 成都生物研究所 61
光电技术研究所 61 广州地球化学研究所 59 新疆生态与地理研究所 59
国家天文台 59 工程热物理研究所 56 寒区旱区环境与工程研究所 48
国家空间科学中心 44 云南天文台 44 南海海洋研究所 42
武汉植物园 42 数学与系统科学研究院 40 上海微系统与信息技术研究所 40
紫金山天文台 39 武汉物理与数学研究所 35 理论物理研究所 34
南京地理与湖泊研究所 32 水土保持研究所 29 文献情报中心 26
昆明动物研究所 25 电子学研究所 23 山西煤炭化学研究所 20
上海天文台 20 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 19 深海科学与工程研究所 18
天津工业生物技术研究所 15 古脊椎动物与古人类研究所 15 东北地理与农业生态研究所 14
新疆天文台 14 青藏高原研究所 13 微电子研究所 12
上海营养与健康研究所 12 上海生物化学与细胞生物学研究所 10 国家授时中心 10
福建物质结构研究所 8 武汉病毒研究所 8 科技战略咨询研究院 7
南京地质古生物研究所 6 城市环境研究所 5 计算机网络信息中心 5
测量与地球物理研究所 4 广州生物医药与健康研究院 4 动物研究所 3
自然科学史研究所 2 亚热带农业生态研究所 2 上海神经科学研究所 2
南京天文光学技术研究所 2 苏州生物医学工程技术研究所 1 生物物理研究所 1
兰州油气资源研究中心 1