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地理科学与资源研究所 798 高能物理研究所 622 寒区旱区环境与工程研究所 370
西北高原生物研究所 267 物理研究所 194 遥感与数字地球研究所 191
昆明动物研究所 188 数学与系统科学研究院 186 植物研究所 184
化学研究所 178 上海应用物理研究所 160 半导体研究所 145
上海药物研究所 140 近代物理研究所 138 金属研究所 128
青海盐湖研究所 125 广州生物医药与健康研究院 118 过程工程研究所 118
广州地球化学研究所 114 生态环境研究中心 106 中国科学院大学 98
深圳先进技术研究院 94 成都山地灾害与环境研究所 92 地质与地球物理研究所 90
昆明植物研究所 90 南京地理与湖泊研究所 86 国家天文台 79
合肥物质科学研究院 79 大连化学物理研究所 78 长春光学精密机械与物理研究所 62
宁波材料技术与工程研究所 59 西安光学精密机械研究所 52 心理研究所 48
自动化研究所 47 青藏高原研究所 44 武汉物理与数学研究所 42
力学研究所 40 计算技术研究所 38 新疆天文台 38
地球环境研究所 38 海洋研究所 37 水土保持研究所 34
长春应用化学研究所 34 新疆生态与地理研究所 32 南京地质古生物研究所 32
地球化学研究所 32 动物研究所 32 兰州化学物理研究所 32
沈阳应用生态研究所 31 沈阳自动化研究所 31 上海微系统与信息技术研究所 30
上海生物化学与细胞生物学研究所 28 南海海洋研究所 26 上海硅酸盐研究所 26
上海光学精密机械研究所 25 紫金山天文台 25 理论物理研究所 23
光电技术研究所 23 西双版纳热带植物园 22 工程热物理研究所 22
东北地理与农业生态研究所 19 重庆绿色智能技术研究院 17 云南天文台 17
武汉植物园 16 武汉岩土力学研究所 16 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 15
上海天文台 15 软件研究所 15 南京土壤研究所 14
烟台海岸带研究所 13 成都生物研究所 12 深海科学与工程研究所 12
广州能源研究所 12 天津工业生物技术研究所 12 水生生物研究所 11
古脊椎动物与古人类研究所 11 生物物理研究所 10 福建物质结构研究所 10
上海营养与健康研究所 9 新疆理化技术研究所 6 上海技术物理研究所 6
上海有机化学研究所 5 华南植物园 5 国家空间科学中心 4
科技战略咨询研究院 4 亚热带农业生态研究所 3 测量与地球物理研究所 3
上海神经科学研究所 2 微电子研究所 2 文献情报中心 2
山西煤炭化学研究所 1 自然科学史研究所 1 武汉病毒研究所 1
国家授时中心 1