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软件研究所 1272 沈阳自动化研究所 785 自动化研究所 615
高能物理研究所 597 长春光学精密机械与物理研究所 446 地理科学与资源研究所 329
计算技术研究所 277 中国科学院大学 213 上海光学精密机械研究所 193
成都山地灾害与环境研究所 190 西安光学精密机械研究所 187 深圳先进技术研究院 186
合肥物质科学研究院 183 近代物理研究所 174 过程工程研究所 168
国家空间科学中心 146 武汉岩土力学研究所 135 心理研究所 131
数学与系统科学研究院 124 西北高原生物研究所 124 力学研究所 118
声学研究所 114 金属研究所 108 光电技术研究所 104
地质与地球物理研究所 102 云南天文台 101 上海药物研究所 100
大连化学物理研究所 90 遥感与数字地球研究所 80 工程热物理研究所 68
植物研究所 63 上海天文台 61 国家天文台 60
南京天文光学技术研究所 59 昆明植物研究所 55 新疆天文台 54
生态环境研究中心 54 重庆绿色智能技术研究院 52 海洋研究所 47
上海应用物理研究所 46 水生生物研究所 45 寒区旱区环境与工程研究所 43
水土保持研究所 43 烟台海岸带研究所 43 西双版纳热带植物园 42
昆明动物研究所 41 文献情报中心 35 紫金山天文台 35
广州能源研究所 33 新疆生态与地理研究所 32 国家授时中心 32
化学研究所 29 计算机网络信息中心 29 物理研究所 25
武汉物理与数学研究所 22 长春应用化学研究所 22 上海生物化学与细胞生物学研究所 21
天津工业生物技术研究所 20 半导体研究所 19 宁波材料技术与工程研究所 17
新疆理化技术研究所 15 沈阳应用生态研究所 14 成都生物研究所 13
电子学研究所 12 科技战略咨询研究院 12 测量与地球物理研究所 12
地球环境研究所 12 兰州化学物理研究所 12 南海海洋研究所 11
上海营养与健康研究所 11 理论物理研究所 9 武汉病毒研究所 9
东北地理与农业生态研究所 8 上海微系统与信息技术研究所 8 青岛生物能源与过程研究所 8
上海硅酸盐研究所 8 古脊椎动物与古人类研究所 8 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 7
青海盐湖研究所 7 南京地理与湖泊研究所 7 深海科学与工程研究所 7
南京地质古生物研究所 6 南京土壤研究所 6 武汉植物园 6
青藏高原研究所 4 微电子研究所 4 上海有机化学研究所 4
广州地球化学研究所 2 广州生物医药与健康研究院 2 上海技术物理研究所 2
自然科学史研究所 1 地球化学研究所 1