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地理科学与资源研究所 1915 自动化研究所 553 上海药物研究所 499
生态环境研究中心 441 地质与地球物理研究所 400 心理研究所 383
西北高原生物研究所 296 成都山地灾害与环境研究所 281 国家天文台 273
植物研究所 263 海洋研究所 261 大连化学物理研究所 256
高能物理研究所 250 深圳先进技术研究院 241 昆明动物研究所 224
昆明植物研究所 223 沈阳自动化研究所 221 合肥物质科学研究院 213
数学与系统科学研究院 211 中国科学院大学 190 水生生物研究所 187
上海营养与健康研究所 185 西双版纳热带植物园 178 上海生物化学与细胞生物学研究所 172
计算技术研究所 170 金属研究所 152 近代物理研究所 143
烟台海岸带研究所 138 寒区旱区环境与工程研究所 125 理论物理研究所 122
力学研究所 121 西安光学精密机械研究所 117 武汉植物园 112
紫金山天文台 111 长春光学精密机械与物理研究所 110 地球环境研究所 109
南海海洋研究所 108 化学研究所 105 云南天文台 104
物理研究所 101 过程工程研究所 100 上海应用物理研究所 95
武汉岩土力学研究所 84 软件研究所 80 重庆绿色智能技术研究院 71
上海天文台 70 地球化学研究所 69 沈阳应用生态研究所 66
遥感与数字地球研究所 59 古脊椎动物与古人类研究所 59 长春应用化学研究所 58
新疆天文台 53 国家空间科学中心 49 武汉物理与数学研究所 49
新疆理化技术研究所 48 水土保持研究所 47 青岛生物能源与过程研究所 46
上海光学精密机械研究所 46 成都生物研究所 45 武汉病毒研究所 45
东北地理与农业生态研究所 43 南京地理与湖泊研究所 42 天津工业生物技术研究所 40
科技战略咨询研究院 32 广州能源研究所 32 宁波材料技术与工程研究所 30
文献情报中心 28 新疆生态与地理研究所 27 上海神经科学研究所 25
半导体研究所 25 南京土壤研究所 23 深海科学与工程研究所 22
工程热物理研究所 22 青藏高原研究所 21 南京地质古生物研究所 21
上海有机化学研究所 21 光电技术研究所 19 上海硅酸盐研究所 19
兰州化学物理研究所 19 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 16 青海盐湖研究所 13
声学研究所 12 计算机网络信息中心 10 广州生物医药与健康研究院 7
动物研究所 7 测量与地球物理研究所 6 国家授时中心 6
南京天文光学技术研究所 4 生物物理研究所 3 广州地球化学研究所 2
微电子研究所 2 上海技术物理研究所 2 上海微系统与信息技术研究所 1