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昆明植物研究所 208 西北高原生物研究所 165 植物研究所 83
地理科学与资源研究所 82 高能物理研究所 79 昆明动物研究所 79
水生生物研究所 78 数学与系统科学研究院 61 自动化研究所 61
遥感与数字地球研究所 34 西双版纳热带植物园 33 海洋研究所 33
中国科学院大学 30 成都生物研究所 25 深圳先进技术研究院 24
长春光学精密机械与物理研究所 24 武汉植物园 23 紫金山天文台 21
成都山地灾害与环境研究所 20 烟台海岸带研究所 19 计算技术研究所 16
国家空间科学中心 16 上海天文台 16 国家天文台 16
沈阳自动化研究所 16 声学研究所 14 云南天文台 13
古脊椎动物与古人类研究所 12 地质与地球物理研究所 11 青藏高原研究所 10
光电技术研究所 10 深海科学与工程研究所 10 南海海洋研究所 9
南京地质古生物研究所 9 心理研究所 9 天津工业生物技术研究所 9
青岛生物能源与过程研究所 8 西安光学精密机械研究所 8 寒区旱区环境与工程研究所 7
武汉病毒研究所 7 金属研究所 6 理论物理研究所 6
上海药物研究所 6 软件研究所 6 新疆生态与地理研究所 5
地球环境研究所 5 东北地理与农业生态研究所 4 上海光学精密机械研究所 4
物理研究所 3 上海应用物理研究所 3 上海生物化学与细胞生物学研究所 3
沈阳应用生态研究所 3 生态环境研究中心 3 力学研究所 2
电子学研究所 2 南京土壤研究所 2 上海微系统与信息技术研究所 2
武汉物理与数学研究所 2 武汉岩土力学研究所 2 半导体研究所 2
宁波材料技术与工程研究所 1 化学研究所 1 新疆理化技术研究所 1
大连化学物理研究所 1 南京地理与湖泊研究所 1 微电子研究所 1
过程工程研究所 1 动物研究所 1 南京天文光学技术研究所 1
重庆绿色智能技术研究院 1 上海营养与健康研究所 1 水土保持研究所 1
合肥物质科学研究院 1 广州能源研究所 1 国家授时中心 1