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地理科学与资源研究所 344 数学与系统科学研究院 238 自动化研究所 229
力学研究所 181 高能物理研究所 162 西安光学精密机械研究所 161
沈阳自动化研究所 123 地质与地球物理研究所 102 工程热物理研究所 98
成都山地灾害与环境研究所 82 武汉岩土力学研究所 82 合肥物质科学研究院 80
长春光学精密机械与物理研究所 78 过程工程研究所 75 金属研究所 74
化学研究所 73 上海光学精密机械研究所 72 近代物理研究所 71
理论物理研究所 70 深圳先进技术研究院 66 紫金山天文台 65
物理研究所 62 国家天文台 59 生态环境研究中心 59
西北高原生物研究所 58 中国科学院大学 53 大连化学物理研究所 52
心理研究所 45 长春应用化学研究所 44 云南天文台 41
上海天文台 33 软件研究所 33 计算技术研究所 31
国家空间科学中心 29 上海药物研究所 29 地球环境研究所 28
海洋研究所 27 烟台海岸带研究所 27 寒区旱区环境与工程研究所 26
武汉物理与数学研究所 26 重庆绿色智能技术研究院 25 植物研究所 24
光电技术研究所 21 上海应用物理研究所 21 西双版纳热带植物园 19
沈阳应用生态研究所 19 新疆理化技术研究所 17 昆明植物研究所 17
南海海洋研究所 15 水土保持研究所 15 声学研究所 14
武汉植物园 14 宁波材料技术与工程研究所 13 地球化学研究所 12
新疆天文台 12 半导体研究所 11 上海硅酸盐研究所 11
遥感与数字地球研究所 10 广州能源研究所 10 南京地理与湖泊研究所 9
南京土壤研究所 9 新疆生态与地理研究所 8 科技战略咨询研究院 8
测量与地球物理研究所 8 青岛生物能源与过程研究所 8 昆明动物研究所 8
古脊椎动物与古人类研究所 8 水生生物研究所 7 兰州化学物理研究所 7
国家授时中心 7 福建物质结构研究所 6 东北地理与农业生态研究所 6
上海微系统与信息技术研究所 6 青藏高原研究所 5 成都生物研究所 4
上海有机化学研究所 4 上海生物化学与细胞生物学研究所 4 上海营养与健康研究所 4
上海神经科学研究所 3 南京地质古生物研究所 3 青海盐湖研究所 3
广州地球化学研究所 2 电子学研究所 2 武汉病毒研究所 2
南京天文光学技术研究所 2 自然科学史研究所 1 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 1
广州生物医药与健康研究院 1 微电子研究所 1 深海科学与工程研究所 1
上海技术物理研究所 1 文献情报中心 1