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大连化学物理研究所 276 地理科学与资源研究所 266 过程工程研究所 266
力学研究所 227 化学研究所 185 上海光学精密机械研究所 185
沈阳自动化研究所 178 生态环境研究中心 175 自动化研究所 171
物理研究所 165 长春应用化学研究所 161 西安光学精密机械研究所 160
地质与地球物理研究所 150 长春光学精密机械与物理研究所 149 金属研究所 147
数学与系统科学研究院 131 西北高原生物研究所 126 高能物理研究所 117
上海药物研究所 94 合肥物质科学研究院 90 近代物理研究所 87
中国科学院大学 83 武汉岩土力学研究所 83 上海应用物理研究所 70
成都山地灾害与环境研究所 65 心理研究所 65 兰州化学物理研究所 65
深圳先进技术研究院 59 半导体研究所 56 上海硅酸盐研究所 51
海洋研究所 48 烟台海岸带研究所 46 上海有机化学研究所 41
武汉物理与数学研究所 38 国家天文台 37 紫金山天文台 37
理论物理研究所 36 宁波材料技术与工程研究所 36 光电技术研究所 36
青岛生物能源与过程研究所 34 广州能源研究所 32 计算技术研究所 31
重庆绿色智能技术研究院 31 国家空间科学中心 30 成都生物研究所 29
西双版纳热带植物园 26 新疆理化技术研究所 26 寒区旱区环境与工程研究所 23
沈阳应用生态研究所 23 上海天文台 20 软件研究所 20
古脊椎动物与古人类研究所 20 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 17 新疆生态与地理研究所 17
声学研究所 17 植物研究所 17 工程热物理研究所 17
遥感与数字地球研究所 15 地球化学研究所 15 南京天文光学技术研究所 15
云南天文台 15 地球环境研究所 15 昆明植物研究所 14
水土保持研究所 14 青海盐湖研究所 13 上海生物化学与细胞生物学研究所 13
昆明动物研究所 12 南京地理与湖泊研究所 11 水生生物研究所 10
武汉病毒研究所 10 南京土壤研究所 9 上海营养与健康研究所 8
国家授时中心 8 青藏高原研究所 7 南海海洋研究所 6
科技战略咨询研究院 5 武汉植物园 5 文献情报中心 4
天津工业生物技术研究所 4 福建物质结构研究所 3 微电子研究所 3
新疆天文台 3 上海技术物理研究所 3 自然科学史研究所 2
测量与地球物理研究所 2 深海科学与工程研究所 2 上海神经科学研究所 1
上海微系统与信息技术研究所 1 计算机网络信息中心 1