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高能物理研究所 693 近代物理研究所 444 地质与地球物理研究所 256
上海药物研究所 235 昆明植物研究所 220 水生生物研究所 215
上海应用物理研究所 213 合肥物质科学研究院 200 地理科学与资源研究所 164
化学研究所 160 广州地球化学研究所 149 中国科学院大学 138
金属研究所 132 植物研究所 110 海洋研究所 107
大连化学物理研究所 99 物理研究所 84 国家天文台 83
西北高原生物研究所 82 半导体研究所 81 心理研究所 79
地球化学研究所 71 宁波材料技术与工程研究所 69 南海海洋研究所 68
生态环境研究中心 67 上海硅酸盐研究所 60 成都山地灾害与环境研究所 58
武汉物理与数学研究所 54 自动化研究所 52 动物研究所 51
广州生物医药与健康研究院 46 西安光学精密机械研究所 45 过程工程研究所 44
古脊椎动物与古人类研究所 44 深圳先进技术研究院 42 西双版纳热带植物园 42
成都生物研究所 42 上海营养与健康研究所 42 云南天文台 41
南京地理与湖泊研究所 40 紫金山天文台 38 广州能源研究所 37
数学与系统科学研究院 36 遥感与数字地球研究所 35 上海生物化学与细胞生物学研究所 34
力学研究所 33 寒区旱区环境与工程研究所 32 长春光学精密机械与物理研究所 30
上海天文台 30 计算技术研究所 29 重庆绿色智能技术研究院 29
昆明动物研究所 29 理论物理研究所 28 深海科学与工程研究所 26
南京地质古生物研究所 25 地球环境研究所 25 长春应用化学研究所 25
青海盐湖研究所 24 沈阳应用生态研究所 23 烟台海岸带研究所 22
工程热物理研究所 21 武汉病毒研究所 20 新疆天文台 20
上海光学精密机械研究所 20 武汉植物园 19 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 17
新疆生态与地理研究所 16 新疆理化技术研究所 15 青岛生物能源与过程研究所 15
兰州化学物理研究所 13 生物物理研究所 12 天津工业生物技术研究所 12
水土保持研究所 11 青藏高原研究所 10 光电技术研究所 10
国家空间科学中心 9 亚热带农业生态研究所 9 南京土壤研究所 9
武汉岩土力学研究所 9 国家授时中心 8 软件研究所 7
上海微系统与信息技术研究所 6 沈阳自动化研究所 6 上海神经科学研究所 5
山西煤炭化学研究所 4 南京天文光学技术研究所 4 文献情报中心 3
长春人造卫星观测站 2 福建物质结构研究所 2 上海有机化学研究所 2
计算机网络信息中心 2 自然科学史研究所 1 科技战略咨询研究院 1
测量与地球物理研究所 1 东北地理与农业生态研究所 1 微电子研究所 1