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地理科学与资源研究所 480 西北高原生物研究所 442 上海药物研究所 420
金属研究所 390 大连化学物理研究所 361 地质与地球物理研究所 357
合肥物质科学研究院 333 化学研究所 297 植物研究所 297
近代物理研究所 273 过程工程研究所 269 高能物理研究所 256
生态环境研究中心 244 心理研究所 222 半导体研究所 218
西安光学精密机械研究所 211 昆明植物研究所 207 沈阳应用生态研究所 206
海洋研究所 185 动物研究所 175 深圳先进技术研究院 170
自动化研究所 168 国家天文台 161 中国科学院大学 156
地球化学研究所 144 广州地球化学研究所 143 国家授时中心 121
上海硅酸盐研究所 115 武汉岩土力学研究所 114 工程热物理研究所 112
宁波材料技术与工程研究所 107 长春光学精密机械与物理研究所 96 武汉植物园 94
寒区旱区环境与工程研究所 91 兰州化学物理研究所 91 南京地理与湖泊研究所 85
武汉物理与数学研究所 84 紫金山天文台 83 沈阳自动化研究所 81
成都山地灾害与环境研究所 80 上海营养与健康研究所 74 新疆生态与地理研究所 71
广州生物医药与健康研究院 69 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 68 上海光学精密机械研究所 68
水生生物研究所 65 烟台海岸带研究所 64 地球环境研究所 62
青海盐湖研究所 57 遥感与数字地球研究所 57 水土保持研究所 57
南海海洋研究所 55 光电技术研究所 54 计算技术研究所 53
青岛生物能源与过程研究所 53 南京地质古生物研究所 52 上海应用物理研究所 50
南京土壤研究所 49 力学研究所 47 新疆理化技术研究所 47
重庆绿色智能技术研究院 46 长春应用化学研究所 46 云南天文台 45
东北地理与农业生态研究所 44 数学与系统科学研究院 43 上海天文台 41
软件研究所 40 华南植物园 39 西双版纳热带植物园 38
生物物理研究所 37 物理研究所 36 微电子研究所 34
科技战略咨询研究院 33 深海科学与工程研究所 29 昆明动物研究所 29
上海生物化学与细胞生物学研究所 28 文献情报中心 28 上海有机化学研究所 27
广州能源研究所 27 新疆天文台 26 上海微系统与信息技术研究所 25
电子学研究所 24 古脊椎动物与古人类研究所 24 国家空间科学中心 23
理论物理研究所 22 青藏高原研究所 20 声学研究所 20
成都生物研究所 18 上海技术物理研究所 12 武汉病毒研究所 11
天津工业生物技术研究所 11 山西煤炭化学研究所 10 南京天文光学技术研究所 10
上海神经科学研究所 9 兰州油气资源研究中心 9 亚热带农业生态研究所 8
计算机网络信息中心 4 长春人造卫星观测站 2 城市环境研究所 2
自然科学史研究所 1