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高能物理研究所 1122 地理科学与资源研究所 951 近代物理研究所 700
上海药物研究所 661 大连化学物理研究所 565 化学研究所 559
金属研究所 515 昆明植物研究所 458 西北高原生物研究所 456
生态环境研究中心 435 合肥物质科学研究院 358 植物研究所 335
半导体研究所 321 地质与地球物理研究所 318 物理研究所 314
长春光学精密机械与物理研究所 314 兰州化学物理研究所 303 沈阳自动化研究所 270
海洋研究所 252 西安光学精密机械研究所 250 过程工程研究所 249
上海应用物理研究所 245 自动化研究所 242 广州地球化学研究所 232
中国科学院大学 227 宁波材料技术与工程研究所 224 心理研究所 187
山西煤炭化学研究所 162 深圳先进技术研究院 162 力学研究所 156
长春应用化学研究所 155 动物研究所 154 上海硅酸盐研究所 146
国家天文台 143 重庆绿色智能技术研究院 135 南京地理与湖泊研究所 132
地球化学研究所 126 昆明动物研究所 126 云南天文台 122
南海海洋研究所 115 计算技术研究所 103 武汉物理与数学研究所 102
理论物理研究所 100 遥感与数字地球研究所 97 水生生物研究所 97
上海微系统与信息技术研究所 96 西双版纳热带植物园 92 寒区旱区环境与工程研究所 91
上海光学精密机械研究所 90 工程热物理研究所 88 青岛生物能源与过程研究所 87
紫金山天文台 87 成都山地灾害与环境研究所 85 新疆理化技术研究所 81
南京地质古生物研究所 78 广州能源研究所 78 沈阳应用生态研究所 76
烟台海岸带研究所 76 上海生物化学与细胞生物学研究所 75 武汉岩土力学研究所 73
上海营养与健康研究所 68 上海有机化学研究所 67 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 63
数学与系统科学研究院 63 光电技术研究所 63 广州生物医药与健康研究院 55
微电子研究所 55 上海天文台 51 新疆生态与地理研究所 50
新疆天文台 49 地球环境研究所 49 生物物理研究所 48
武汉植物园 46 国家空间科学中心 44 古脊椎动物与古人类研究所 44
武汉病毒研究所 34 东北地理与农业生态研究所 31 南京土壤研究所 30
上海技术物理研究所 29 上海神经科学研究所 28 国家授时中心 28
深海科学与工程研究所 27 青藏高原研究所 26 成都生物研究所 26
科技战略咨询研究院 25 青海盐湖研究所 19 福建物质结构研究所 18
软件研究所 17 天津工业生物技术研究所 17 亚热带农业生态研究所 14
水土保持研究所 14 文献情报中心 10 声学研究所 8
计算机网络信息中心 8 电子学研究所 5 兰州油气资源研究中心 5
南京天文光学技术研究所 5 华南植物园 5 测量与地球物理研究所 3
城市环境研究所 1