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高能物理研究所 709 上海药物研究所 450 近代物理研究所 445
地质与地球物理研究所 349 化学研究所 335 地理科学与资源研究所 305
西北高原生物研究所 296 昆明植物研究所 296 合肥物质科学研究院 267
半导体研究所 264 大连化学物理研究所 255 上海应用物理研究所 234
金属研究所 229 长春应用化学研究所 229 沈阳自动化研究所 219
生态环境研究中心 163 植物研究所 155 广州地球化学研究所 149
物理研究所 148 宁波材料技术与工程研究所 146 过程工程研究所 142
水生生物研究所 141 海洋研究所 130 中国科学院大学 126
自动化研究所 122 南海海洋研究所 118 心理研究所 101
动物研究所 100 国家天文台 93 地球化学研究所 91
武汉物理与数学研究所 87 云南天文台 83 深圳先进技术研究院 81
西安光学精密机械研究所 78 紫金山天文台 78 重庆绿色智能技术研究院 69
上海硅酸盐研究所 69 上海微系统与信息技术研究所 65 广州生物医药与健康研究院 61
长春光学精密机械与物理研究所 58 上海光学精密机械研究所 58 青藏高原研究所 54
上海营养与健康研究所 52 成都山地灾害与环境研究所 51 福建物质结构研究所 51
计算技术研究所 49 上海生物化学与细胞生物学研究所 48 遥感与数字地球研究所 47
工程热物理研究所 47 武汉植物园 46 南京地质古生物研究所 45
理论物理研究所 41 西双版纳热带植物园 39 成都生物研究所 38
苏州纳米技术与纳米仿生研究所 37 昆明动物研究所 37 烟台海岸带研究所 35
兰州化学物理研究所 35 新疆理化技术研究所 34 新疆天文台 31
广州能源研究所 31 光电技术研究所 30 南京土壤研究所 30
地球环境研究所 30 力学研究所 28 上海天文台 28
南京地理与湖泊研究所 28 国家空间科学中心 22 青岛生物能源与过程研究所 22
沈阳应用生态研究所 22 数学与系统科学研究院 21 寒区旱区环境与工程研究所 21
武汉病毒研究所 21 武汉岩土力学研究所 21 生物物理研究所 20
青海盐湖研究所 18 深海科学与工程研究所 18 古脊椎动物与古人类研究所 17
上海技术物理研究所 16 新疆生态与地理研究所 14 水土保持研究所 12
软件研究所 11 天津工业生物技术研究所 10 上海神经科学研究所 9
亚热带农业生态研究所 8 声学研究所 8 微电子研究所 5
计算机网络信息中心 4 文献情报中心 3 东北地理与农业生态研究所 2
上海有机化学研究所 2 国家授时中心 2 苏州生物医学工程技术研究所 1
山西煤炭化学研究所 1 长春人造卫星观测站 1