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自动化研究所 418 地理科学与资源研究所 264 近代物理研究所 257
高能物理研究所 193 物理研究所 160 上海药物研究所 157
合肥物质科学研究院 151 大连化学物理研究所 140 西安光学精密机械研究所 140
金属研究所 138 地质与地球物理研究所 131 化学研究所 120
心理研究所 111 西北高原生物研究所 105 昆明植物研究所 104
植物研究所 102 生态环境研究中心 94 上海应用物理研究所 88
半导体研究所 86 过程工程研究所 83 国家天文台 76
长春光学精密机械与物理研究所 68 重庆绿色智能技术研究院 68 宁波材料技术与工程研究所 63
中国科学院大学 56 南海海洋研究所 54 广州地球化学研究所 54
地球环境研究所 40 云南天文台 39 动物研究所 38
武汉物理与数学研究所 37 海洋研究所 37 计算技术研究所 36
地球化学研究所 36 成都山地灾害与环境研究所 35 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 35
理论物理研究所 33 兰州化学物理研究所 33 长春应用化学研究所 32
遥感与数字地球研究所 30 紫金山天文台 30 青藏高原研究所 29
寒区旱区环境与工程研究所 29 上海硅酸盐研究所 29 昆明动物研究所 28
武汉岩土力学研究所 27 南京地质古生物研究所 26 力学研究所 25
沈阳自动化研究所 25 成都生物研究所 23 数学与系统科学研究院 23
烟台海岸带研究所 23 武汉植物园 21 西双版纳热带植物园 20
上海神经科学研究所 20 广州生物医药与健康研究院 19 光电技术研究所 19
上海生物化学与细胞生物学研究所 19 深圳先进技术研究院 18 沈阳应用生态研究所 17
广州能源研究所 17 工程热物理研究所 17 上海营养与健康研究所 15
水生生物研究所 14 上海微系统与信息技术研究所 14 软件研究所 14
生物物理研究所 12 南京地理与湖泊研究所 12 新疆理化技术研究所 11
新疆天文台 11 东北地理与农业生态研究所 10 深海科学与工程研究所 10
上海光学精密机械研究所 10 国家空间科学中心 9 上海天文台 8
武汉病毒研究所 8 青岛生物能源与过程研究所 7 水土保持研究所 7
新疆生态与地理研究所 6 科技战略咨询研究院 6 声学研究所 6
山西煤炭化学研究所 4 青海盐湖研究所 3 南京土壤研究所 3
上海有机化学研究所 3 天津工业生物技术研究所 3 苏州生物医学工程技术研究所 2
古脊椎动物与古人类研究所 2 亚热带农业生态研究所 1 福建物质结构研究所 1
微电子研究所 1 计算机网络信息中心 1 南京天文光学技术研究所 1
文献情报中心 1