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近代物理研究所 202 水生生物研究所 193 合肥物质科学研究院 157
高能物理研究所 132 大连化学物理研究所 115 上海药物研究所 96
西安光学精密机械研究所 86 地理科学与资源研究所 76 工程热物理研究所 64
化学研究所 63 云南天文台 63 地质与地球物理研究所 50
过程工程研究所 47 半导体研究所 47 金属研究所 46
地球化学研究所 40 上海硅酸盐研究所 40 广州地球化学研究所 39
广州能源研究所 36 宁波材料技术与工程研究所 34 上海光学精密机械研究所 34
西北高原生物研究所 30 昆明植物研究所 30 自动化研究所 30
植物研究所 28 亚热带农业生态研究所 25 烟台海岸带研究所 25
深圳先进技术研究院 24 生态环境研究中心 24 长春光学精密机械与物理研究所 23
计算技术研究所 22 昆明动物研究所 22 南京地理与湖泊研究所 21
成都山地灾害与环境研究所 20 上海应用物理研究所 19 长春应用化学研究所 19
中国科学院大学 18 南京地质古生物研究所 17 水土保持研究所 17
重庆绿色智能技术研究院 16 国家天文台 15 心理研究所 15
武汉植物园 14 寒区旱区环境与工程研究所 13 光电技术研究所 13
动物研究所 13 深海科学与工程研究所 12 南京土壤研究所 11
武汉物理与数学研究所 11 海洋研究所 11 力学研究所 10
国家空间科学中心 10 理论物理研究所 10 南海海洋研究所 9
遥感与数字地球研究所 9 新疆天文台 9 上海营养与健康研究所 9
沈阳应用生态研究所 9 地球环境研究所 9 文献情报中心 9
生物物理研究所 8 新疆生态与地理研究所 8 新疆理化技术研究所 8
物理研究所 7 上海天文台 7 沈阳自动化研究所 7
兰州化学物理研究所 7 西双版纳热带植物园 6 上海微系统与信息技术研究所 6
测量与地球物理研究所 5 广州生物医药与健康研究院 5 武汉病毒研究所 5
上海有机化学研究所 5 华南植物园 5 古脊椎动物与古人类研究所 5
山西煤炭化学研究所 4 武汉岩土力学研究所 4 软件研究所 4
苏州纳米技术与纳米仿生研究所 3 电子学研究所 3 成都生物研究所 3
微电子研究所 3 上海生物化学与细胞生物学研究所 3 青藏高原研究所 2
数学与系统科学研究院 2 青岛生物能源与过程研究所 2 天津工业生物技术研究所 2
紫金山天文台 2 青海盐湖研究所 1 计算机网络信息中心 1