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高能物理研究所 283 近代物理研究所 156 化学研究所 136
上海应用物理研究所 92 地理科学与资源研究所 85 上海药物研究所 67
广州地球化学研究所 66 自动化研究所 59 云南天文台 58
中国科学院大学 44 合肥物质科学研究院 43 昆明植物研究所 42
物理研究所 36 大连化学物理研究所 36 生态环境研究中心 35
植物研究所 30 上海营养与健康研究所 29 地球环境研究所 29
兰州化学物理研究所 29 紫金山天文台 27 金属研究所 24
地质与地球物理研究所 24 新疆理化技术研究所 24 水生生物研究所 24
国家天文台 23 长春应用化学研究所 23 海洋研究所 20
半导体研究所 19 上海天文台 18 理论物理研究所 15
宁波材料技术与工程研究所 14 动物研究所 14 西安光学精密机械研究所 13
国家空间科学中心 12 长春光学精密机械与物理研究所 12 数学与系统科学研究院 11
西北高原生物研究所 11 寒区旱区环境与工程研究所 11 过程工程研究所 11
深圳先进技术研究院 10 上海光学精密机械研究所 10 成都山地灾害与环境研究所 9
计算技术研究所 9 西双版纳热带植物园 9 南京地质古生物研究所 9
新疆生态与地理研究所 8 成都生物研究所 8 武汉物理与数学研究所 8
地球化学研究所 8 武汉植物园 8 水土保持研究所 8
沈阳应用生态研究所 8 烟台海岸带研究所 8 南京地理与湖泊研究所 7
新疆天文台 7 南海海洋研究所 5 青海盐湖研究所 5
遥感与数字地球研究所 5 重庆绿色智能技术研究院 5 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 4
广州生物医药与健康研究院 4 光电技术研究所 4 心理研究所 4
南京土壤研究所 4 青岛生物能源与过程研究所 4 上海生物化学与细胞生物学研究所 4
古脊椎动物与古人类研究所 4 生物物理研究所 3 青藏高原研究所 3
武汉岩土力学研究所 3 天津工业生物技术研究所 3 力学研究所 2
科技战略咨询研究院 2 武汉病毒研究所 2 沈阳自动化研究所 2
广州能源研究所 2 昆明动物研究所 2 上海神经科学研究所 1
上海微系统与信息技术研究所 1 声学研究所 1 上海硅酸盐研究所 1
国家授时中心 1 工程热物理研究所 1