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高能物理研究所 913 近代物理研究所 528 上海药物研究所 489
合肥物质科学研究院 334 化学研究所 313 上海应用物理研究所 299
西北高原生物研究所 259 地质与地球物理研究所 258 半导体研究所 253
物理研究所 226 宁波材料技术与工程研究所 226 昆明植物研究所 217
中国科学院大学 213 广州地球化学研究所 211 地理科学与资源研究所 205
植物研究所 200 金属研究所 181 大连化学物理研究所 170
上海硅酸盐研究所 163 福建物质结构研究所 148 生态环境研究中心 145
深圳先进技术研究院 138 云南天文台 134 自动化研究所 131
海洋研究所 117 上海营养与健康研究所 117 长春应用化学研究所 101
地球化学研究所 98 过程工程研究所 94 上海微系统与信息技术研究所 92
西安光学精密机械研究所 91 重庆绿色智能技术研究院 90 动物研究所 89
心理研究所 85 烟台海岸带研究所 85 遥感与数字地球研究所 81
国家天文台 81 上海光学精密机械研究所 81 广州能源研究所 81
长春光学精密机械与物理研究所 78 广州生物医药与健康研究院 76 武汉物理与数学研究所 76
成都山地灾害与环境研究所 72 水生生物研究所 72 成都生物研究所 71
南海海洋研究所 69 南京地质古生物研究所 67 工程热物理研究所 60
地球环境研究所 59 上海生物化学与细胞生物学研究所 54 南京地理与湖泊研究所 53
计算技术研究所 51 紫金山天文台 51 青岛生物能源与过程研究所 48
生物物理研究所 46 西双版纳热带植物园 42 武汉植物园 42
苏州纳米技术与纳米仿生研究所 38 光电技术研究所 37 数学与系统科学研究院 35
深海科学与工程研究所 35 寒区旱区环境与工程研究所 34 新疆天文台 34
兰州化学物理研究所 33 理论物理研究所 31 昆明动物研究所 28
上海天文台 27 武汉病毒研究所 26 上海技术物理研究所 26
力学研究所 25 南京土壤研究所 25 武汉岩土力学研究所 22
水土保持研究所 22 天津工业生物技术研究所 22 青藏高原研究所 21
沈阳应用生态研究所 20 青海盐湖研究所 18 新疆理化技术研究所 18
新疆生态与地理研究所 17 沈阳自动化研究所 16 软件研究所 16
国家授时中心 13 国家空间科学中心 10 古脊椎动物与古人类研究所 10
上海神经科学研究所 9 微电子研究所 7 亚热带农业生态研究所 5
声学研究所 4 上海有机化学研究所 3 计算机网络信息中心 3
苏州生物医学工程技术研究所 2 城市环境研究所 2 科技战略咨询研究院 2
自然科学史研究所 1 长春人造卫星观测站 1 东北地理与农业生态研究所 1
文献情报中心 1