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高能物理研究所 579 近代物理研究所 372 合肥物质科学研究院 259
上海应用物理研究所 253 上海药物研究所 233 化学研究所 180
地理科学与资源研究所 178 地质与地球物理研究所 176 深圳先进技术研究院 168
生态环境研究中心 163 昆明植物研究所 151 西北高原生物研究所 146
物理研究所 134 广州地球化学研究所 132 金属研究所 121
国家天文台 108 大连化学物理研究所 102 植物研究所 102
中国科学院大学 98 云南天文台 90 水生生物研究所 87
过程工程研究所 85 南京地质古生物研究所 83 紫金山天文台 81
西安光学精密机械研究所 79 地球环境研究所 75 地球化学研究所 64
理论物理研究所 60 动物研究所 60 半导体研究所 60
宁波材料技术与工程研究所 59 南京地理与湖泊研究所 58 海洋研究所 57
自动化研究所 56 南海海洋研究所 54 广州生物医药与健康研究院 54
广州能源研究所 54 心理研究所 45 数学与系统科学研究院 44
上海营养与健康研究所 42 上海生物化学与细胞生物学研究所 37 兰州化学物理研究所 37
武汉岩土力学研究所 36 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 35 长春光学精密机械与物理研究所 35
长春应用化学研究所 35 工程热物理研究所 35 国家空间科学中心 34
上海光学精密机械研究所 34 上海硅酸盐研究所 34 成都山地灾害与环境研究所 31
武汉物理与数学研究所 31 昆明动物研究所 30 力学研究所 29
上海微系统与信息技术研究所 27 南京土壤研究所 24 沈阳应用生态研究所 24
遥感与数字地球研究所 23 上海天文台 22 青岛生物能源与过程研究所 21
西双版纳热带植物园 20 武汉植物园 20 寒区旱区环境与工程研究所 17
烟台海岸带研究所 17 生物物理研究所 16 青藏高原研究所 16
新疆理化技术研究所 16 光电技术研究所 15 福建物质结构研究所 14
新疆天文台 14 深海科学与工程研究所 14 计算技术研究所 13
青海盐湖研究所 13 天津工业生物技术研究所 13 古脊椎动物与古人类研究所 13
重庆绿色智能技术研究院 12 国家授时中心 12 沈阳自动化研究所 11
成都生物研究所 8 武汉病毒研究所 8 软件研究所 6
山西煤炭化学研究所 5 新疆生态与地理研究所 5 上海神经科学研究所 5
微电子研究所 5 上海技术物理研究所 5 科技战略咨询研究院 4
亚热带农业生态研究所 3 城市环境研究所 3 水土保持研究所 3
测量与地球物理研究所 2 声学研究所 1 计算机网络信息中心 1