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高能物理研究所 552 自动化研究所 383 近代物理研究所 370
上海应用物理研究所 192 宁波材料技术与工程研究所 184 上海药物研究所 147
长春应用化学研究所 129 合肥物质科学研究院 101 昆明植物研究所 95
化学研究所 84 云南天文台 84 金属研究所 75
上海光学精密机械研究所 72 大连化学物理研究所 66 物理研究所 65
西北高原生物研究所 61 地理科学与资源研究所 55 动物研究所 53
半导体研究所 50 植物研究所 49 地质与地球物理研究所 47
中国科学院大学 46 西安光学精密机械研究所 46 国家天文台 45
福建物质结构研究所 44 上海天文台 43 武汉物理与数学研究所 43
地球化学研究所 40 深圳先进技术研究院 35 成都山地灾害与环境研究所 29
水生生物研究所 28 心理研究所 27 上海营养与健康研究所 27
上海微系统与信息技术研究所 26 海洋研究所 26 过程工程研究所 25
广州地球化学研究所 24 光电技术研究所 24 生态环境研究中心 23
武汉植物园 22 遥感与数字地球研究所 21 寒区旱区环境与工程研究所 20
地球环境研究所 19 武汉病毒研究所 18 紫金山天文台 18
成都生物研究所 17 广州生物医药与健康研究院 16 上海硅酸盐研究所 16
天津工业生物技术研究所 16 理论物理研究所 14 南京地质古生物研究所 14
南京土壤研究所 14 计算技术研究所 13 国家空间科学中心 13
新疆理化技术研究所 13 沈阳应用生态研究所 13 南京地理与湖泊研究所 12
南海海洋研究所 10 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 10 长春光学精密机械与物理研究所 10
力学研究所 9 武汉岩土力学研究所 9 西双版纳热带植物园 8
数学与系统科学研究院 8 青岛生物能源与过程研究所 8 烟台海岸带研究所 8
青海盐湖研究所 7 新疆天文台 7 重庆绿色智能技术研究院 7
工程热物理研究所 7 软件研究所 6 昆明动物研究所 6
兰州化学物理研究所 6 新疆生态与地理研究所 5 上海生物化学与细胞生物学研究所 5
水土保持研究所 5 广州能源研究所 5 古脊椎动物与古人类研究所 5
苏州生物医学工程技术研究所 4 生物物理研究所 4 上海神经科学研究所 3
深海科学与工程研究所 3 上海技术物理研究所 3 青藏高原研究所 2
亚热带农业生态研究所 1 长春人造卫星观测站 1 城市环境研究所 1
科技战略咨询研究院 1 东北地理与农业生态研究所 1 声学研究所 1
计算机网络信息中心 1 沈阳自动化研究所 1 国家授时中心 1