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高能物理研究所 401 近代物理研究所 256 西北高原生物研究所 171
上海药物研究所 167 化学研究所 146 昆明植物研究所 136
合肥物质科学研究院 112 大连化学物理研究所 105 物理研究所 98
地理科学与资源研究所 92 中国科学院大学 78 植物研究所 76
西安光学精密机械研究所 73 金属研究所 72 国家天文台 69
半导体研究所 68 生态环境研究中心 62 宁波材料技术与工程研究所 61
过程工程研究所 58 海洋研究所 50 动物研究所 50
云南天文台 48 心理研究所 45 长春光学精密机械与物理研究所 44
地质与地球物理研究所 37 南京地理与湖泊研究所 36 地球化学研究所 36
计算技术研究所 35 上海硅酸盐研究所 35 水生生物研究所 31
紫金山天文台 31 自动化研究所 30 生物物理研究所 28
成都山地灾害与环境研究所 26 上海营养与健康研究所 26 数学与系统科学研究院 25
寒区旱区环境与工程研究所 25 广州地球化学研究所 24 遥感与数字地球研究所 24
地球环境研究所 24 兰州化学物理研究所 24 武汉物理与数学研究所 23
力学研究所 21 重庆绿色智能技术研究院 21 深圳先进技术研究院 20
天津工业生物技术研究所 19 上海应用物理研究所 18 长春应用化学研究所 17
理论物理研究所 16 广州生物医药与健康研究院 16 武汉病毒研究所 16
光电技术研究所 16 烟台海岸带研究所 14 南海海洋研究所 13
上海天文台 13 青海盐湖研究所 13 武汉植物园 13
上海光学精密机械研究所 13 新疆天文台 12 昆明动物研究所 12
国家授时中心 12 沈阳应用生态研究所 11 广州能源研究所 11
青藏高原研究所 10 西双版纳热带植物园 10 深海科学与工程研究所 10
国家空间科学中心 9 青岛生物能源与过程研究所 9 古脊椎动物与古人类研究所 9
工程热物理研究所 9 成都生物研究所 8 南京地质古生物研究所 7
南京土壤研究所 7 武汉岩土力学研究所 7 软件研究所 7
新疆生态与地理研究所 6 新疆理化技术研究所 6 微电子研究所 6
上海微系统与信息技术研究所 6 上海生物化学与细胞生物学研究所 6 东北地理与农业生态研究所 5
声学研究所 5 福建物质结构研究所 4 城市环境研究所 4
沈阳自动化研究所 4 苏州生物医学工程技术研究所 3 计算机网络信息中心 2
水土保持研究所 2 长春人造卫星观测站 1 上海技术物理研究所 1