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高能物理研究所 456 近代物理研究所 265 上海药物研究所 199
大连化学物理研究所 176 生态环境研究中心 164 西北高原生物研究所 163
地理科学与资源研究所 139 广州地球化学研究所 139 化学研究所 118
地质与地球物理研究所 113 半导体研究所 108 金属研究所 104
合肥物质科学研究院 101 物理研究所 96 兰州化学物理研究所 82
云南天文台 74 国家天文台 70 过程工程研究所 67
宁波材料技术与工程研究所 66 植物研究所 59 昆明植物研究所 57
海洋研究所 57 上海应用物理研究所 54 自动化研究所 50
中国科学院大学 48 遥感与数字地球研究所 41 紫金山天文台 38
动物研究所 36 上海光学精密机械研究所 36 西安光学精密机械研究所 35
广州能源研究所 33 长春光学精密机械与物理研究所 29 科技战略咨询研究院 29
重庆绿色智能技术研究院 28 理论物理研究所 26 上海天文台 26
上海营养与健康研究所 26 深圳先进技术研究院 25 成都山地灾害与环境研究所 25
数学与系统科学研究院 25 心理研究所 25 地球化学研究所 25
青藏高原研究所 23 广州生物医药与健康研究院 22 武汉岩土力学研究所 21
上海硅酸盐研究所 21 水生生物研究所 20 新疆天文台 19
南京地质古生物研究所 16 南海海洋研究所 15 南京土壤研究所 15
力学研究所 14 武汉植物园 14 计算技术研究所 13
水土保持研究所 13 工程热物理研究所 13 烟台海岸带研究所 12
天津工业生物技术研究所 12 武汉物理与数学研究所 11 沈阳应用生态研究所 11
地球环境研究所 11 长春应用化学研究所 11 青岛生物能源与过程研究所 10
沈阳自动化研究所 10 古脊椎动物与古人类研究所 10 深海科学与工程研究所 9
苏州纳米技术与纳米仿生研究所 8 西双版纳热带植物园 8 武汉病毒研究所 8
上海生物化学与细胞生物学研究所 8 南京地理与湖泊研究所 7 昆明动物研究所 7
生物物理研究所 6 福建物质结构研究所 6 成都生物研究所 6
青海盐湖研究所 6 寒区旱区环境与工程研究所 6 新疆理化技术研究所 6
国家空间科学中心 5 新疆生态与地理研究所 5 光电技术研究所 5
国家授时中心 5 东北地理与农业生态研究所 4 软件研究所 4
上海微系统与信息技术研究所 3 南京天文光学技术研究所 3 亚热带农业生态研究所 2
上海神经科学研究所 2 文献情报中心 2 山西煤炭化学研究所 1
上海有机化学研究所 1