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近代物理研究所 329 高能物理研究所 293 上海应用物理研究所 164
长春应用化学研究所 123 化学研究所 122 上海药物研究所 116
地理科学与资源研究所 113 大连化学物理研究所 110 金属研究所 104
昆明植物研究所 99 地质与地球物理研究所 94 烟台海岸带研究所 88
物理研究所 85 西北高原生物研究所 81 云南天文台 81
植物研究所 79 中国科学院大学 77 过程工程研究所 75
半导体研究所 72 合肥物质科学研究院 71 自动化研究所 60
上海硅酸盐研究所 56 宁波材料技术与工程研究所 51 广州地球化学研究所 47
遥感与数字地球研究所 42 国家天文台 42 动物研究所 40
长春光学精密机械与物理研究所 37 新疆理化技术研究所 36 海洋研究所 35
生态环境研究中心 32 理论物理研究所 31 西安光学精密机械研究所 30
紫金山天文台 30 成都山地灾害与环境研究所 29 兰州化学物理研究所 27
上海光学精密机械研究所 26 重庆绿色智能技术研究院 23 上海营养与健康研究所 22
青岛生物能源与过程研究所 19 成都生物研究所 18 新疆天文台 18
寒区旱区环境与工程研究所 17 光电技术研究所 17 国家授时中心 17
计算技术研究所 16 数学与系统科学研究院 16 心理研究所 16
沈阳应用生态研究所 16 上海生物化学与细胞生物学研究所 15 武汉岩土力学研究所 15
力学研究所 14 深圳先进技术研究院 14 青藏高原研究所 14
南京地质古生物研究所 13 青海盐湖研究所 13 水生生物研究所 13
地球环境研究所 13 国家空间科学中心 12 新疆生态与地理研究所 12
昆明动物研究所 12 微电子研究所 11 软件研究所 11
地球化学研究所 10 武汉物理与数学研究所 9 深海科学与工程研究所 9
工程热物理研究所 9 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 8 上海天文台 8
南海海洋研究所 7 武汉病毒研究所 7 武汉植物园 7
福建物质结构研究所 6 广州能源研究所 6 西双版纳热带植物园 5
南京地理与湖泊研究所 5 生物物理研究所 4 山西煤炭化学研究所 4
南京土壤研究所 4 文献情报中心 3 科技战略咨询研究院 2
上海神经科学研究所 2 广州生物医药与健康研究院 2 水土保持研究所 2
天津工业生物技术研究所 2 古脊椎动物与古人类研究所 2 城市环境研究所 1
测量与地球物理研究所 1 上海有机化学研究所 1 声学研究所 1
南京天文光学技术研究所 1 沈阳自动化研究所 1