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近代物理研究所 331 高能物理研究所 205 上海应用物理研究所 132
地理科学与资源研究所 119 大连化学物理研究所 104 昆明植物研究所 94
上海药物研究所 84 物理研究所 76 地质与地球物理研究所 70
西北高原生物研究所 63 自动化研究所 57 植物研究所 56
云南天文台 55 成都山地灾害与环境研究所 53 化学研究所 51
合肥物质科学研究院 49 金属研究所 43 生态环境研究中心 42
动物研究所 41 计算技术研究所 40 广州地球化学研究所 38
宁波材料技术与工程研究所 37 西安光学精密机械研究所 35 中国科学院大学 34
国家天文台 33 地球化学研究所 30 上海硅酸盐研究所 28
水生生物研究所 27 武汉物理与数学研究所 27 沈阳应用生态研究所 27
过程工程研究所 25 古脊椎动物与古人类研究所 23 心理研究所 21
西双版纳热带植物园 18 半导体研究所 18 南海海洋研究所 16
深圳先进技术研究院 16 深海科学与工程研究所 16 广州能源研究所 16
紫金山天文台 15 理论物理研究所 14 寒区旱区环境与工程研究所 14
新疆天文台 14 昆明动物研究所 14 南京地理与湖泊研究所 13
海洋研究所 13 武汉植物园 13 重庆绿色智能技术研究院 13
数学与系统科学研究院 12 上海营养与健康研究所 11 长春光学精密机械与物理研究所 10
南京地质古生物研究所 10 遥感与数字地球研究所 10 广州生物医药与健康研究院 10
地球环境研究所 10 上海天文台 9 青海盐湖研究所 9
上海光学精密机械研究所 9 新疆理化技术研究所 8 上海微系统与信息技术研究所 8
生物物理研究所 7 成都生物研究所 7 力学研究所 5
国家空间科学中心 5 新疆生态与地理研究所 5 青岛生物能源与过程研究所 5
武汉岩土力学研究所 5 南京土壤研究所 4 上海生物化学与细胞生物学研究所 4
青藏高原研究所 3 光电技术研究所 3 水土保持研究所 3
烟台海岸带研究所 3 亚热带农业生态研究所 2 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 2
福建物质结构研究所 2 武汉病毒研究所 2 软件研究所 2
工程热物理研究所 2 上海神经科学研究所 1 东北地理与农业生态研究所 1
声学研究所 1 长春应用化学研究所 1 天津工业生物技术研究所 1
兰州化学物理研究所 1 国家授时中心 1